מידע על פפטידים

המונח 'פפטיד' מקורו במילה היוונית 'πέσσειν' (pessein), שמשמעותה 'לעכל'. פפטיד הוא תרכובת שנוצרת על ידי חומצות אמינו המקושרות באמצעות קשרי פפטיד. קשרי פפטיד, שהם קשרי אמיד, נוצרים מהתעבות התייבשות בין קבוצת α-carboxyl של חומצת אמינו אחת לקבוצת α-amino של אחרת. מסווגים לפי ספירת חומצות אמינו, פפטידים עם 2 עד 20 חומצות אמינו נקראים אוליגופפטידים, אלו עם 20 עד 50 הם פוליפפטידים, ורצפים העולים על 50 חומצות אמינו עם מבנים מרחביים ספציפיים מסווגים בדרך כלל כחלבונים. לפפטידים יש בדרך כלל משקל מולקולרי מתחת ל-10 kDa. קרא עוד

קשר פפטיד הוא קשר קוולנטי אופייני במולקולות חלבון, הנוצר באמצעות תגובת עיבוי של התייבשות בין קבוצת α-carboxyl (α-COOH) של חומצת אמינו אחת וקבוצת α-amino (-NH₂) של חומצת אמינו סמוכה. הטבע הכימי שלו הוא קשר אמיד. קרא עוד

סינתזת פפטידים מתייחסת לתהליך של בניית רצפי חומצות אמינו ויצירת קשרי אמיד (כלומר, קשרי פפטיד) באמצעים כימיים או ביולוגיים, המאפשרים בעצם בנייה מלאכותית של מולקולות אוליגופפטיד או פוליפפטיד בעלות פונקציות ביולוגיות ספציפיות. כענף קריטי בכימיה ביו-אורגנית, טכנולוגיה זו מתמקדת בהפעלה סלקטיבית של מונומרים של חומצות אמינו, צימוד כיווני ובקרה מדויקת של הרכבת הרצף, המשתרעת על כל הספקטרום מהכנת מעבדה בקנה מידה מיליגרם ועד לייצור תעשייתי בקנה מידה קילוגרם. בהתבסס על אסטרטגיות סינתטיות שונות, היא מסווגת לשיטות ביוסינתטיות הנשענות על מערכות ביולוגיות ושיטות סינתזה כימית המבוססות על עקרונות סינתזה אורגנית. קרא עוד

מסיסות פפטיד מתייחסת לכמות המקסימלית של פפטיד שיכולה להתמוסס ביחידת נפח של ממס בתנאי טמפרטורה ו-pH ספציפיים, המאופיינת בדרך כלל בריכוז מסה (g/L) או ריכוז מולארי (mol/L). כתכונה פיזיקוכימית קריטית, היא משפיעה ישירות על תהליכי הספיגה, ההפצה, חילוף החומרים וההפרשה (ADME) של פפטידים in vivo, וכן קובעת את טכנולוגיית ההכנה, יציבות האחסון ויעילות היישום הקלינית של תרופות מבוססות פפטידים. קרא עוד

חומצות אמינו הן תרכובות אורגניות המכילות קבוצת α-amino (α-NH₂) וקבוצת α-carboxyl (α-COOH), עם הנוסחה הכללית RCH(NH₂)COOH. אטום α-פחמן מקושר לקבוצת שרשרת צד מסוימת (קבוצת R), ויוצרים את היחידות המבניות הבסיסיות של מקרומולקולות ביולוגיות. קרא עוד

טיהור פפטידים הוא תהליך של הפרדה והעשרה של תערובות פפטידים גולמיים המתקבלים באמצעות סינתזה או ביטוי באמצעות שיטות פיזיקליות, כימיות או ביולוגיות לרכישת פפטידי מטרה בעלי טוהר גבוה. קרא עוד

תרכובות פפטידים, בשל רצפי חומצות האמינו הספציפיים והמבנים המרחביים שלהן, בעלות את המאפיין שפעילותם הביולוגית רגישות מאוד להשפעות סביבתיות חיצוניות. הרציונל העיקרי לאחסון פפטידים הוא מניעת תגובות כימיות כגון פירוק, חמצון ואגרגציה, ובכך לשמור על שלמות המבנה והתפקודים הביולוגיים שלהם. קרא עוד

פפטידים מחקריים הם מולקולות מעוצבות באופן פונקציונלי המסונתזות במעבדות, שהערך המרכזי שלהן טמון במתן תמיכה אינסטרומנטלית למחקר במדעי החיים ובשימוש בלעדי במסגרות מחקר במבחנה. 'מחקר במבחנה', שמקורו במונח הלטיני 'in vitro' (שפירושו 'בזכוכית'), מתייחס ספציפית למחקרים שנערכו בסביבות ניסוי מבוקרות באופן מלאכותי, כמו תרבית תאים, ניתוח אינטראקציה מולקולרית או מבחני תגובה ביוכימית. קרא עוד