Podľa informácií o peptide 
1. mája 2025
VŠETKY ČLÁNKY A INFORMÁCIE O PRODUKTOCH POSKYTOVANÉ NA TEJTO WEBOVEJ STRÁNKE SÚ VÝHRADNE NA ŠÍRENIE INFORMÁCIÍ A VZDELÁVACIE ÚČELY.
Produkty uvedené na tejto webovej stránke sú určené výhradne na výskum in vitro. Výskum in vitro (lat. *v skle*, čo znamená v skle) sa vykonáva mimo ľudského tela. Tieto produkty nie sú liečivá, neboli schválené americkým Úradom pre kontrolu potravín a liečiv (FDA) a nesmú sa používať na prevenciu, liečbu alebo liečenie akéhokoľvek zdravotného stavu, choroby alebo ochorenia. Vnášať tieto produkty do ľudského alebo zvieracieho tela v akejkoľvek forme je zákonom prísne zakázané.
Čo je to peptid?
Termín 'peptid' pochádza z gréckeho slova 'πέσσειν' (péssein), čo znamená 'tráviť'. Peptid je zlúčenina tvorená aminokyselinami spojenými prostredníctvom peptidových väzieb. Peptidové väzby, ktoré sú amidovými väzbami, vznikajú dehydratačnou kondenzáciou medzi a-karboxylovou skupinou jednej aminokyseliny a a-aminoskupinou inej aminokyseliny. Peptidy s 2 až 20 aminokyselinami klasifikované podľa počtu aminokyselín sa nazývajú oligopeptidy, peptidy s 20 až 50 sú polypeptidy a sekvencie presahujúce 50 aminokyselín so špecifickými priestorovými štruktúrami sa všeobecne kategorizujú ako proteíny. Peptidy majú typicky molekulovú hmotnosť pod 10 kDa. Ich primárna štruktúra pozostáva z lineárnej aminokyselinovej sekvencie a niektoré peptidy môžu vytvárať sekundárne štruktúry, ako sú a-helixy. Peptidy, ktoré vykazujú rôzne funkcie, sú široko zapojené do biologických procesov vrátane prenosu signálu, metabolickej regulácie a imunitných reakcií, čo z nich robí dôležité biomolekuly so štrukturálnou diverzitou a biologickou funkčnosťou v aplikáciách v medicíne, potravinárstve a iných oblastiach.
Ako sa tvoria peptidy?
| K tvorbe peptidov dochádza prostredníctvom väzby aminokyselín prostredníctvom peptidových väzieb, ktoré sa vyskytujú prirodzene in vivo alebo umelo in vitro. V biologických systémoch ribozomálna syntéza zahŕňa mRNA nesúcu genetickú informáciu na riadenie ribozómov pri usporiadaní aktivovaných aminokyselín v špecifickej sekvencii. Transferové RNA (tRNA) dodávajú aminokyseliny do ribozómu, kde enzymatická katalýza poháňa dehydratačnú kondenzáciu medzi α-karboxylovou skupinou jednej aminokyseliny a α-aminoskupinou druhej, pričom sa vytvára amidová (peptidová) väzba a uvoľňuje sa molekula vody; tento proces sa opakuje za vzniku oligopeptidov alebo polypeptidov. Neribozomálna syntéza sa spolieha na špecializované enzýmové komplexy, ako sú peptidové syntetázy, bežne pozorované v mikroorganizmoch produkujúcich bioaktívne peptidy, ako sú antibiotiká. In vitro syntéza primárne využíva syntézu peptidov na pevnej fáze (SPPS), kde sú chránené aminokyseliny postupne naviazané na živicový nosič; deprotekčné a kondenzačné reakcie predlžujú peptidový reťazec postupne. Alternatívne je možné cieľové peptidy získať enzymatickou hydrolýzou prírodných proteínov. Tvorba peptidovej väzby predstavuje proces kovalentnej väzby, ktorý slúži ako jadrová väzba v primárnej štruktúre peptidov a proteínov. Ďalšie podrobnosti o peptidových väzbách sú uvedené v časti 'Peptidové väzby.' |  |
Nomenklatúra peptidov
Názvoslovie peptidov sa zvyčajne odvodzuje od počtu aminokyselín, ktoré obsahujú, podľa konvencie 'číslo + peptid'. Napríklad dipeptid obsahuje dve aminokyseliny, tripeptid tri, a to pokračuje až k dekapeptidu s desiatimi aminokyselinami. Peptidy s viac ako desiatimi aminokyselinami sú priamo pomenované ako '11 - peptid', '20 - peptid' atď. Tento systém pomenovania sa všeobecne vzťahuje na konvenčné lineárne peptidy spojené α-peptidovými väzbami. Existujú však výnimky:
Niektoré cyklické peptidy, ako napríklad cyklosporín a gramicidín, sú pomenované s predponou 'cyklo -' alebo vlastným názvom v dôsledku spojenia hlava-koniec alebo cyklizácie postranného reťazca a môžu obsahovať neprirodzené zložky, ako sú D-aminokyseliny.
Peptidy s jedinečnou konektivitou, ako je glutatión, ktorý má 'γ-peptidovú väzbu' vytvorenú medzi γ-karboxylovou skupinou a α-aminoskupinou, sa neriadia konvenciou číslovania lineárnych α-peptidových väzieb.
Funkčné peptidy, ako sú antimikrobiálne a neuropeptidy, sú pomenované skôr na základe ich biologických funkcií než na základe počtu aminokyselín. Napríklad mellitín, antimikrobiálny peptid s 26 aminokyselinami.
Neribozomálne syntetizované peptidy z mikroorganizmov, ako je bacitracín a aktinomycín, obsahujú modifikované aminokyseliny (napr. metylované alebo cyklizované) a sú pomenované podľa svojho zdroja alebo funkcie vďaka svojim jedinečným biosyntetickým dráham, a nie počtu aminokyselín.
Stručne povedané, tieto výnimky odrážajú rôznorodú povahu peptidovej nomenklatúry, ktorá musí brať do úvahy štrukturálne vlastnosti, syntetické cesty a funkčné charakteristiky.
Klasifikácia peptidov
Peptidy môžu byť kategorizované vo viacerých dimenziách:
Podľa počtu aminokyselín sú vysoko aktívne oligopeptidy pozostávajúce z 2-20 peptidov, ako je dipeptid a glutatión; polypeptidy s 20-50 peptidmi môžu tvoriť jednoduché priestorové štruktúry, ako sú fragmenty inzulinogénu; peptidy s viac ako 50 peptidmi a komplexnými funkciami sú zvyčajne kategorizované ako proteíny, ako je inzulín, ktorý obsahuje 51 aminokyselín.
Chemickou štruktúrou sú lineárne peptidy spojené α-peptidovými väzbami, ako je enkefalín, cyklické peptidy tvoria kruh cez prvý a posledný koniec alebo bočný reťazec, ako je cyklosporín, modifikované peptidy obsahujú neprirodzené zložky, ako sú D-aminokyseliny aktinomycínu, a špeciálne spojené peptidy, ako je glutatión, sú spojené γ-peptidovými väzbami.
Spôsobom syntézy sú ribozomálne syntetické peptidy kódované génmi, ako sú endorfíny, neribozomálne syntetické peptidy sú závislé od komplexov mikrobiálnych enzýmov, ako sú mykopeptidy, a syntetické peptidy sa pripravujú chemickými alebo biologickými prostriedkami, ako je napríklad medicínsky oktreotid.
Podľa funkcie sa signálne peptidy podieľajú na prenose, ako je hormón uvoľňujúci tyrotropín, antibakteriálne peptidy ničia bakteriálne membrány, ako sú peptidy včelieho jedu, neuropeptidy regulujú nervy, ako sú endorfíny, na analgéziu a existujú aj liečivé peptidy a funkčné potravinové peptidy.
Podľa zdroja prírodné peptidy existujú v organizmoch alebo potravinách, ako sú mliečne kazeínové peptidy, a syntetické peptidy prenikajú cez prirodzené obmedzenia umelým zásahom, ako sú kozmetické oligopeptidy.
Podľa biologických zdrojov ich možno kategorizovať na živočíšne zdroje, ako je tenzín, rastlinné zdroje, ako sú sójové peptidy, a mikrobiálne zdroje, ako sú peptidy Mycobacterium avium.
Tieto klasifikácie sa prelínajú, aby odrážali bohatú rozmanitosť peptidov v štruktúre, funkcii a aplikácii.
Dôležité pojmy súvisiace s peptidmi
Peptidová väzba: Amidová väzba -CO-NH- vytvorená dehydratačnou kondenzáciou α-karboxyskupiny jednej aminokyseliny s α-aminoskupinou inej aminokyseliny, čo je základná kovalentná väzba spájajúca aminokyselinové zvyšky a tvoriaca peptidy a proteíny.
Oligopeptid: zvyčajne označuje peptidové zlúčeniny s nízkou molekulovou hmotnosťou, ako je dipeptid, tripeptid atď., ktoré vznikajú spojením 2-20 aminokyselín prostredníctvom peptidovej väzby a majú vysokú biologickú aktivitu a priepustnosť bunkovej membrány.
Polypeptid: peptid zložený z 20-50 aminokyselín, molekulová hmotnosť je zvyčajne menšia ako 10 kDa, môže tvoriť jednoduchú priestorovú štruktúru, ako je a-helix, je funkčnou molekulou medzi oligopeptidom a proteínom.
Primárna štruktúra: aminokyselinová sekvencia peptidu, určená genetickou informáciou alebo umelým dizajnom, je základnou chemickou štruktúrou peptidu, ktorá priamo ovplyvňuje jeho pokročilú štruktúru a biologickú funkciu.
Sekundárna štruktúra: usporiadaná konformácia vytvorená vodíkovou väzbou v lokálnej oblasti peptidového reťazca, ako je α-helix, β-folding, β-turning, atď., ktorá nie je taká stabilná ako u proteínov, ale podieľa sa na tvorbe funkčných miest.
Cyklické peptidy: peptidy, ktoré tvoria cyklickú štruktúru spojením prvej a poslednej aminokyseliny alebo skupín postranných reťazcov, ako je cyklosporín a krátky peptid, s vysokou stabilitou a antienzymatickými vlastnosťami, často obsahujúce v názve predponu 'cyklický'.
Peptidy syntetizované ribozómami: peptidy syntetizované ribozómami živých organizmov prostredníctvom translácie templátu mRNA a ich sekvencie sú kódované génmi, ako je hormón inzulín a neurotransmiter endorfín.
Neribozomálne syntetické peptidy: peptidy syntetizované špeciálnymi enzýmovými komplexmi, ako sú peptidové syntetázy, bežne sa vyskytujúce v mikroorganizmoch, ako sú baktérie a huby, a môžu obsahovať neprirodzené aminokyseliny, ako sú D-aminokyseliny, napr. antibiotikum Mycobacterium avium peptide.
Syntéza peptidov na pevnej fáze (SPPS): In vitro technológia umelej syntézy peptidov, prostredníctvom postupného spájania chránených aminokyselín na nosiči živice, prostredníctvom deprotekčnej, kondenzačnej reakcie na postupné predlžovanie peptidového reťazca, vhodná na krátku presnosť syntézy peptidov.
