Oleh Informasi Peptida 
1 Mei 2025
SEMUA ARTIKEL DAN INFORMASI PRODUK YANG DISEDIAKAN DALAM WEBSITE INI SEPENUHNYA UNTUK PENYEBARAN INFORMASI DAN TUJUAN PENDIDIKAN.
Produk yang disediakan di situs ini ditujukan khusus untuk penelitian in vitro. Penelitian in vitro (bahasa Latin: *in glass*, artinya barang pecah belah) dilakukan di luar tubuh manusia. Produk-produk ini bukan obat-obatan, belum disetujui oleh Badan Pengawas Obat dan Makanan AS (FDA), dan tidak boleh digunakan untuk mencegah, mengobati, atau menyembuhkan kondisi medis, penyakit, atau penyakit apa pun. Dilarang keras oleh hukum untuk memasukkan produk ini ke dalam tubuh manusia atau hewan dalam bentuk apapun.
Apa itu Peptida?
Istilah 'peptida' berasal dari kata Yunani 'πέσσειν' (péssein), yang berarti 'mencerna.' Peptida adalah senyawa yang dibentuk oleh asam amino yang dihubungkan melalui ikatan peptida. Ikatan peptida, yang merupakan ikatan amino, muncul dari kondensasi dehidrasi antara gugus α-karboksil dari satu asam amino dan gugus α-amino dari asam amino lainnya. Diklasifikasikan berdasarkan jumlah asam amino, peptida dengan 2 hingga 20 asam amino disebut oligopeptida, peptida dengan 20 hingga 50 adalah polipeptida, dan rangkaian yang melebihi 50 asam amino dengan struktur spasial spesifik umumnya dikategorikan sebagai protein. Peptida biasanya memiliki berat molekul di bawah 10 kDa. Struktur primernya terdiri dari rangkaian asam amino linier, dan beberapa peptida dapat membentuk struktur sekunder seperti heliks α. Dengan menunjukkan beragam fungsi, peptida banyak terlibat dalam proses biologis termasuk transduksi sinyal, regulasi metabolisme, dan respons imun, menjadikannya biomolekul penting dengan keragaman struktural dan fungsi biologis dalam aplikasi di bidang kedokteran, ilmu pangan, dan bidang lainnya.
Bagaimana Peptida Terbentuk?
| Pembentukan peptida terjadi melalui hubungan asam amino melalui ikatan peptida, terjadi secara alami in vivo atau buatan in vitro. Dalam sistem biologis, sintesis ribosom melibatkan mRNA yang membawa informasi genetik untuk mengarahkan ribosom dalam menyusun asam amino teraktivasi dalam urutan tertentu. Transfer RNA (tRNA) mengantarkan asam amino ke ribosom, di mana katalisis enzimatik mendorong kondensasi dehidrasi antara gugus α-karboksil dari satu asam amino dan gugus α-amino dari asam amino lainnya, membentuk ikatan amino (peptida) dan melepaskan molekul air; proses ini berulang untuk menghasilkan oligopeptida atau polipeptida. Sintesis non-ribosom bergantung pada kompleks enzim khusus seperti sintetase peptida, yang biasa diamati pada mikroorganisme yang memproduksi peptida bioaktif seperti antibiotik. Sintesis in vitro terutama menggunakan sintesis peptida fase padat (SPPS), di mana asam amino yang dilindungi digabungkan secara berurutan ke pendukung resin; reaksi deproteksi dan kondensasi memperluas rantai peptida secara bertahap. Alternatifnya, peptida target dapat diperoleh melalui hidrolisis enzimatik protein alami. Pembentukan ikatan peptida merupakan proses ikatan kovalen, yang berfungsi sebagai penghubung inti dalam struktur utama peptida dan protein. Rincian lebih lanjut mengenai ikatan peptida dibahas di bagian 'Ikatan Peptida.' |  |
Tata Nama Peptida
Tata nama peptida biasanya berasal dari jumlah asam amino yang dikandungnya, mengikuti konvensi 'angka + peptida'. Misalnya, dipeptida terdiri dari dua asam amino, tripeptida terdiri dari tiga asam amino, dan ini berlanjut hingga dekapeptida dengan sepuluh asam amino. Peptida dengan lebih dari sepuluh asam amino diberi nama langsung sebagai '11 - peptida', '20 - peptida', dll. Sistem penamaan ini umumnya berlaku untuk peptida linier konvensional yang dihubungkan dengan ikatan α - peptida. Namun, ada pengecualian:
Beberapa peptida siklik, seperti siklosporin dan gramisidin, diberi nama dengan awalan 'siklo -' atau nama kepemilikan karena sambungan kepala-ke-ekor atau siklisasi rantai samping, dan mungkin mengandung komponen non-alami seperti asam D -amino.
Peptida dengan konektivitas unik, seperti glutathione, yang memiliki 'ikatan γ-peptida' yang terbentuk antara gugus γ-karboksil dan gugus α-amino, tidak mengikuti konvensi penomoran ikatan α-peptida linier.
Peptida fungsional, seperti antimikroba dan neuropeptida, diberi nama berdasarkan fungsi biologisnya, bukan berdasarkan jumlah asam amino. Misalnya mellitin, peptida antimikroba dengan 26 asam amino.
Peptida yang disintesis secara non-ribosom dari mikroorganisme, seperti bacitracin dan actinomycin, mengandung asam amino yang dimodifikasi (misalnya, termetilasi atau tersiklisasi) dan diberi nama berdasarkan sumber atau fungsinya karena jalur biosintetiknya yang unik, bukan berdasarkan jumlah asam amino.
Singkatnya, pengecualian ini mencerminkan sifat beragam tata nama peptida, yang harus mempertimbangkan fitur struktural, rute sintetik, dan karakteristik fungsional.
Klasifikasi peptida
Peptida dapat dikategorikan dalam beberapa dimensi:
Berdasarkan jumlah asam amino, oligopeptida yang terdiri dari 2-20 peptida seperti dipeptida dan glutathione sangat aktif; polipeptida dengan 20-50 peptida dapat membentuk struktur spasial sederhana seperti fragmen insulinogen; Peptida dengan lebih dari 50 peptida dan fungsi kompleks biasanya dikategorikan sebagai protein, seperti insulin yang mengandung 51 asam amino.
Berdasarkan struktur kimianya, peptida linier dihubungkan oleh ikatan α-peptida seperti enkephalin, peptida siklik membentuk cincin melalui ekor pertama dan terakhir atau rantai samping seperti siklosporin, peptida yang dimodifikasi mengandung komponen yang tidak alami seperti asam D-amino dari aktinomisin, dan peptida yang terhubung secara khusus seperti glutathione dihubungkan oleh ikatan γ-peptida.
Melalui cara sintesis, peptida sintetik ribosom dikodekan oleh gen seperti endorfin, peptida sintetik non-ribosom bergantung pada kompleks enzim mikroba seperti mikopeptida, dan peptida sintetik dibuat dengan cara kimia atau biologis seperti oktreotida obat.
Berdasarkan fungsinya, peptida pemberi sinyal terlibat dalam transmisi seperti hormon pelepas tirotropin, peptida antibakteri menghancurkan membran bakteri seperti peptida racun lebah, neuropeptida mengatur saraf seperti endorfin untuk analgesia, dan ada juga peptida obat dan peptida makanan fungsional.
Berdasarkan sumbernya, peptida alami terdapat dalam organisme atau makanan, seperti peptida kasein susu, dan peptida sintetik menerobos keterbatasan alami melalui intervensi buatan, seperti oligopeptida kosmetik.
Berdasarkan sumber biologisnya, dapat dikategorikan menjadi sumber hewani seperti tensin, sumber nabati seperti peptida kedelai, dan sumber mikroba seperti peptida Mycobacterium avium.
Klasifikasi ini saling terkait untuk mencerminkan keragaman peptida dalam struktur, fungsi dan aplikasi.
Istilah penting terkait dengan peptida
Ikatan peptida: Ikatan Amida -CO-NH- dibentuk oleh kondensasi dehidrasi gugus α-karboksi dari satu asam amino dengan gugus α-amino dari asam amino lain, yang merupakan ikatan kovalen basa yang menghubungkan residu asam amino dan membentuk peptida dan protein.
Oligopeptida: biasanya mengacu pada senyawa peptida dengan berat molekul rendah, seperti dipeptida, tripeptida, dll., yang dibentuk dengan menghubungkan 2-20 asam amino melalui ikatan peptida, dan memiliki aktivitas biologis dan permeabilitas membran sel yang tinggi.
Polipeptida: peptida terdiri dari 20-50 asam amino, berat molekul biasanya kurang dari 10 kDa, dapat membentuk struktur spasial sederhana seperti α-helix, merupakan molekul fungsional antara oligopeptida dan protein.
Struktur primer: urutan asam amino peptida, ditentukan oleh informasi genetik atau desain buatan, adalah struktur kimia dasar peptida, yang secara langsung mempengaruhi struktur lanjutan dan fungsi biologisnya.
Struktur sekunder: konformasi terurut yang dibentuk oleh ikatan hidrogen di area lokal rantai peptida, seperti α-helix, β-folding, β-turning, dll., yang tidak stabil seperti protein, tetapi terlibat dalam pembentukan situs fungsional.
Peptida siklik: peptida yang membentuk struktur siklik dengan menghubungkan asam amino pertama dan terakhir atau gugus rantai samping, seperti siklosporin dan peptida pendek, dengan stabilitas tinggi dan fitur anti-enzimatik, sering kali mengandung awalan 'siklik' pada namanya.
Peptida yang disintesis ribosom: peptida yang disintesis oleh ribosom organisme hidup melalui terjemahan templat mRNA, dan urutannya dikodekan oleh gen, seperti hormon insulin dan neurotransmitter endorfin.
Peptida sintetik non-ribosom: peptida yang disintesis oleh kompleks enzim khusus seperti peptida sintetase, umumnya ditemukan pada mikroorganisme seperti bakteri dan jamur, dan mungkin mengandung asam amino yang tidak alami seperti asam D-amino, misalnya antibiotik Mycobacterium avium peptida.
Sintesis Peptida Fase Padat (SPPS): Teknologi sintesis peptida buatan in vitro, melalui penggandengan berurutan asam amino terlindung pada pembawa resin, melalui reaksi deproteksi dan kondensasi untuk memperpanjang rantai peptida secara bertahap, cocok untuk presisi sintesis peptida pendek.
