توسط اطلاعات پپتید 
1 مه 2025
تمام مقالات و اطلاعات محصول ارائه شده در این وب سایت صرفاً برای انتشار اطلاعات و اهداف آموزشی است.
محصولات ارائه شده در این وب سایت منحصراً برای تحقیقات آزمایشگاهی در نظر گرفته شده است. تحقیقات آزمایشگاهی (لاتین: *in glass*، به معنی در ظروف شیشه ای) خارج از بدن انسان انجام می شود. این محصولات دارویی نیستند، توسط سازمان غذا و داروی ایالات متحده (FDA) تایید نشده اند و نباید برای پیشگیری، درمان یا درمان هر گونه بیماری، بیماری یا بیماری استفاده شوند. ورود این محصولات به بدن انسان یا حیوان به هر شکلی طبق قانون اکیدا ممنوع است.
پپتید چیست؟
هنگامی که بقایای اسید آمینه از طریق پیوندهای پپتیدی به هم متصل می شوند، یک پپتید تشکیل می شود. در یک پپتید α معمولی، پیوند کربن کربونیل یک باقیمانده اسید آمینه را با نیتروژن باقیمانده بعدی متصل می کند و ستون فقرات مشخصه مشترک پپتیدها و پروتئین ها را ایجاد می کند.
ساده ترین پپتیدها فقط حاوی چند اسید آمینه هستند. به مولکولی که دارای دو باقیمانده است، دی پپتید می گویند ، در حالی که سه باقیمانده یک تری پپتید را تشکیل می دهند . پیشوندهای عددی مشابه برای دنباله های کوتاه دیگر استفاده می شود.
برای زنجیره های طولانی تر، معمولاً از اصطلاحاتی مانند اولیگوپپتید و پلی پپتید استفاده می شود، اگرچه مرزهای عددی آنها در بین رشته های علمی کاملاً یکنواخت نیست. بنابراین بهتر است این اصطلاحات را بهعنوان مقولههای توصیفی تلقی کنیم تا طبقهبندیهای مطلق بر اساس یک شمارش باقیمانده.
به همین ترتیب، هیچ تعداد واحدی از باقی مانده اسید آمینه وجود ندارد که در آن یک پپتید به طور خودکار به پروتئین تبدیل شود. طبقه بندی پروتئین همچنین ساختار مرتبه بالاتر، چین خوردگی، سازمان بیولوژیکی و زمینه علمی را منعکس می کند.
توالی اسید آمینه پپتید ساختار اولیه آن است . این توالی بسیاری از ویژگی های اساسی آن را تعیین می کند، از جمله جرم مولکولی، بار خالص، آبگریزی و گروه های شیمیایی موجود برای برهمکنش های بین مولکولی.
در شرایط مناسب، زنجیرههای پپتیدی نیز ممکن است ویژگیهای ساختاری ثانویه مانند ترکیبات مارپیچ α، ساختار β، چرخشها یا ترکیبهای کمتر مرتب شده را اتخاذ کنند. میزان پذیرش پپتید این ساختارها به توالی و محیط تجربی آن بستگی دارد.
پپتیدها چگونه تشکیل می شوند؟
پپتیدها می توانند از طریق بیوسنتز بیولوژیکی ایجاد شوند یا از طریق روش های آزمایشگاهی کنترل شده تهیه شوند. در سیستم های زنده، بسیاری از پپتیدها و پروتئین ها از طریق ترجمه ریبوزومی تولید می شوند . RNA پیام رسان اطلاعات توالی کدگذاری شده را حمل می کند، در حالی که مولکول های RNA انتقالی اسیدهای آمینه را به ترتیب لازم به ریبوزوم می رسانند. در ریبوزوم، تشکیل پیوند پپتیدی در مرکز پپتیدیل ترانسفراز کاتالیز می شود. زنجیره پپتیدی در حال رشد از پپتیدیل-tRNA به گروه آمینو آمینواسیل-tRNA ورودی منتقل می شود. چرخه های مکرر این واکنش، هر بار باقیمانده زنجیره را گسترش می دهد. این مکانیسم بهطور دقیقتر بهعنوان یک فرآیند انتقال آسیل که شامل واسطههای متصل به tRNA فعال میشود، به جای آبگیری مستقیم بین دو اسید آمینه آزاد توصیف میشود. همه پپتیدهای طبیعی توسط ریبوزوم ها تولید نمی شوند. پپتید سنتتازهای غیر ریبوزومی سیستم های آنزیمی بزرگی هستند که پپتیدهای خاصی را مستقل از ترجمه ریبوزومی جمع می کنند. این مسیرها به ویژه در شیمی محصولات طبیعی میکروبی مهم هستند و می توانند اسیدهای آمینه D، باقیمانده های غیر پروتئینی، ساختارهای حلقوی و سایر ویژگی های شیمیایی غیر معمول را معرفی کنند. پپتیدها را می توان به صورت مصنوعی نیز تهیه کرد. یکی از مهمترین روشهای آزمایشگاهی سنتز پپتید فاز جامد یا SPPS است. در SPPS، اولین اسید آمینه به یک رزین جامد متصل می شود و اسیدهای آمینه محافظت شده اضافی به ترتیب اضافه می شوند. چرخه های مکرر محافظت زدایی و جفت شدن زنجیره پپتیدی را تا زمانی که توالی هدف جمع شود گسترش می دهد. سپس پپتید از رزین جدا میشود، گروههای محافظ حذف میشوند و ماده بهدستآمده خالص شده و به صورت تحلیلی مشخص میشود. بسته به توالی هدف، روشهای آمادهسازی دیگر ممکن است شامل سنتز فاز محلول، بیان نوترکیب، بستن آنزیمی یا ترکیبی از این رویکردها باشد. |
 |
پیوند پپتیدی
پیوند پپتیدی یک پیوند آمیدی است و ارتباط ساختاری مرکزی بین باقی ماندههای اسید آمینه را تشکیل میدهد.
یکی از ویژگی های شیمیایی مهم پیوند پپتیدی، ویژگی پیوند دوگانه جزئی آن است. رزونانس بین گروه کربونیل و نیتروژن آمیدی چرخش آزاد در اطراف پیوند C-N را محدود می کند. این هندسه محدود به رفتار ساختاری ستون فقرات پپتید کمک می کند.
اگرچه پیوند پپتیدی به خودی خود نسبتاً ساده است، ترکیب کلی یک پپتید به بسیاری از عوامل اضافی از جمله زنجیره های جانبی اسید آمینه، شرایط حلال، pH، دما، قدرت یونی و برهمکنش با سایر مولکول ها بستگی دارد.
نامگذاری پپتیدها
نام پپتیدها ممکن است منعکس کننده تعداد باقیمانده، توالی، ساختار، منبع یا قرارداد علمی ثابت باشد.
برای پپتیدهای خطی کوتاه، پیشوندهای عددی ساده هستند:
دو باقی مانده: دی پپتید
سه باقی مانده: تری پپتید
چهار باقیمانده: تتراپپتید
پنج باقیمانده: پنتاپپتید
شش باقیمانده: هگزاپپتید
هفت باقیمانده: هپتاپپتید
هشت باقیمانده: اکتاپپتید
نه باقیمانده: nonapeptide
ده باقیمانده: دکاپپتید
برای پپتیدهای طولانیتر، نامگذاری علمی معمولاً بیشتر بر توالی، نامهای پذیرفتهشده بیوشیمیایی یا ویژگیهای ساختاری متکی است تا عبارات سادهای مانند '20-peptide'.
برخی از پپتیدها به قراردادهای نامگذاری تخصصی تری نیاز دارند.
پپتیدهای حلقوی حاوی یک ساختار بسته کووالانسی هستند که از طریق چرخه شدن سر به دم، پیوندهای زنجیره جانبی، پل های دی سولفیدی یا سایر اتصالات درون مولکولی تشکیل شده است.
برخی از پپتیدها حاوی پیوندهای پپتیدی غیر استاندارد هستند . به عنوان مثال، گلوتاتیون حاوی یک پیوند γ-گلوتامیل به جای تکیه کامل بر پیوندهای پپتیدی α معمولی است.
سایر پپتیدها حاوی باقیمانده های اصلاح شده شیمیایی، اسیدهای آمینه D، اسیدهای آمینه غیر پروتئین زا، گروه های لیپیدی، گروه های کربوهیدراتی یا سایر تغییرات ساختاری هستند.
این مثالها نشان میدهند که چرا نامگذاری پپتید را نمیتوان به تنهایی به تعداد اسیدهای آمینه کاهش داد.
طبقه بندی پپتیدها
پپتیدها ممکن است به چند روش مختلف طبقه بندی شوند.
پپتیدهای کوتاه را می توان دقیقاً به عنوان دی پپتید، تری پپتید، تتراپپتید و غیره توصیف کرد.
اصطلاحات اولیگوپپتید و پلی پپتید گسترده تر هستند و نباید به عنوان دارای مرزهای ثابت جهانی تلقی شوند.
پپتیدها ممکن است:
خطی
چرخه ای
منشعب
اصلاح شده شیمیایی
از طریق اوراق قرضه غیر استاندارد مرتبط شده است
طبقه بندی ساختاری به ویژه مفید است زیرا معماری مولکولی می تواند به شدت بر رفتار ساختاری، پایداری، حلالیت و خواص تحلیلی تأثیر بگذارد.
پپتیدها ممکن است از طریق زیر تولید شوند:
بیوسنتز ریبوزومی
بیوسنتز غیر ریبوزومی
سنتز شیمیایی
بیان نوترکیب
سنتز یا بستن آنزیمی
هر مسیر ملاحظات عملی و تحلیلی متفاوتی دارد.
در تحقیقات آزمایشگاهی، پپتیدها ممکن است به صورت زیر مورد مطالعه قرار گیرند:
لیگاندهای اتصال گیرنده
مولکول های سیگنال
سوبستراها یا مهارکننده های آنزیمی
پروب های ساختاری
مواد مرجع تحلیلی
ابزارهای مولکولی برچسب دار
اجزای مدل های تحقیقاتی بیوشیمیایی یا سلولی
این دستهها کاربرد تجربی را توصیف میکنند و نباید به عنوان نشانههای بالینی تفسیر شوند.
یک الیگوپپتید یک پپتید نسبتا کوتاه است که حاوی تعداد محدودی از اسیدهای آمینه باقی مانده است. محدوده عددی دقیق با زمینه علمی متفاوت است.
بنابراین، فرض این که همه الیگوپپتیدها دارای خصوصیاتی مانند فعالیت بیولوژیکی بالا یا نفوذپذیری بالای غشاء هستند، مناسب نیست. این ویژگی ها به مولکول فردی بستگی دارد.
پلی پپتید یک زنجیره طولانی تر از بقایای اسید آمینه است که توسط پیوندهای پپتیدی به هم متصل شده اند.
پلی پپتیدها ممکن است نسبتاً انعطاف پذیر باقی بمانند یا ممکن است ساختارهای ثانویه یا سوم سازمان یافته را بسته به توالی و شرایط محیطی اتخاذ کنند.
ساختار اولیه به دنباله اسید آمینه یک پپتید اشاره دارد که به طور معمول از انتهای N تا C-پایانه نوشته می شود.
توالی خواص مولکولی بنیادی را تعیین می کند و پایه شیمیایی ساختار مرتبه بالاتر را فراهم می کند.
ساختار ثانویه به ترکیبات محلی تکرار شونده در زنجیره پپتیدی، از جمله α-مارپیچ، ساختارهای β و چرخش اشاره دارد.
هر پپتید یک ساختار ثانویه پایدار تشکیل نمی دهد. ساختار می تواند به طور قابل توجهی با حلال، pH، غلظت، دما و برهمکنش های اتصال متفاوت باشد.
یک پپتید حلقوی حاوی حداقل یک اتصال کووالانسی است که بخشی یا تمام زنجیره پپتیدی را به یک حلقه می بندد.
چرخهشدن ممکن است انعطافپذیری ساختاری را کاهش دهد و میتواند پایداری شیمیایی و مقاومت در برابر مسیرهای تخریب خاص را تغییر دهد، اگرچه این اثرات مختص مولکولها هستند.
یک پپتید سنتز شده از طریق ریبوزوم از طریق ترجمه یک توالی رمزگذاری شده ژنتیکی تولید می شود.
برخی از این پپتیدها متعاقباً پس از ترجمه از طریق فرآیندهایی مانند برش، اکسیداسیون، چرخهشدن یا افزودن گروههای شیمیایی اصلاح میشوند.
یک پپتید غیر ریبوزومی به جای ریبوزوم ها توسط کمپلکس های آنزیمی تخصصی مونتاژ می شود.
چنین پپتیدهایی می توانند دارای ویژگی های ساختاری باشند که در پپتیدهای سنتز شده از طریق ریبوزومی کمتر رایج هستند، از جمله اسیدهای آمینه D و باقیمانده های غیر پروتئین زا.
سنتز پپتید فاز جامد یکی از پرکاربردترین روشها برای تهیه توالیهای پپتیدی تعریفشده است.
پپتید در حال رشد به یک تکیه گاه جامد متصل می شود، در حالی که اسیدهای آمینه محافظت شده به طور متوالی اضافه می شوند. یک چرخه سنتز معمولی شامل محافظت زدایی، جفت شدن، شستشو و تکرار چرخه تا تکمیل توالی مورد نظر است.
پس از مونتاژ زنجیر، پپتید از رزین جدا می شود و تحت محافظت زدایی، خالص سازی و خصوصیات تحلیلی قرار می گیرد.
SPPS به ویژه مفید است زیرا امکان کنترل دقیق توالی را فراهم می کند و می تواند بسیاری از اسیدهای آمینه اصلاح شده یا غیر طبیعی را در خود جای دهد.
سنتز پپتید به طور خودکار مواد شیمیایی همگن تولید نمی کند.
مخلوط های مصنوعی ممکن است حاوی توالی های کوتاه شده، محصولات حذف، محصولات جفت ناقص، محصولات واکنش جانبی، معرف های باقی مانده یا سایر ناخالصی ها باشند.
به همین دلیل، خالصسازی و توصیف تحلیلی بخشهای ضروری آمادهسازی پپتید هستند.
کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا فاز معکوس (RP-HPLC) به طور گسترده در خالص سازی و تجزیه پپتید استفاده می شود. این اجزا را با توجه به تفاوت در تعامل آنها با فاز ثابت و متحرک کروماتوگرافی جدا می کند.
همچنین می توان از HPLC تحلیلی برای تخمین خلوص کروماتوگرافی استفاده کرد.
ارزشی مانند:
خلوص ≥99% توسط HPLC
باید به عنوان خلوص کروماتوگرافی تحت شرایط تحلیلی مشخص شده درک شود. لزوماً به این معنی نیست که 99٪ از کل جرم فیزیکی ویال از پپتید هدف تشکیل شده است.
این تمایز در تجزیه و تحلیل پپتید حرفه ای مهم است.
طیف سنجی جرمی اطلاعات مختلفی را ارائه می دهد. معمولاً برای اندازه گیری جرم مولکولی و تأیید هویت مولکولی استفاده می شود.
بنابراین، خلوص HPLC و هویت طیفسنجی جرمی به سؤالات تحلیلی مختلف پاسخ میدهند و نباید به عنوان اندازهگیریهای قابل تعویض تلقی شوند.
بسته به پپتید و هدف تحقیق، سایر روشهای تحلیلی نیز ممکن است مرتبط باشند، از جمله آنالیز اسید آمینه، تعیین آب، آنالیز ضد یون، آزمایش حلال باقیمانده، یا تکنیکهای طیفسنجی.
پپتیدها مواد تحقیقاتی ارزشمندی هستند زیرا توالی و ساختار شیمیایی آنها را می توان به طور دقیق تعریف کرد و به طور سیستماتیک اصلاح کرد.
تحقیقات آزمایشگاهی ممکن است ساختار پپتید، برهمکنشهای مولکولی، اتصال گیرنده، فعالیت آنزیم، سیگنالدهی بیوشیمیایی، پایداری، حلالیت، تجمع، یا برهمکنشهای پپتید-پروتئین را بررسی کند.
رفتار تجربی را می توان تحت تأثیر متغیرهای متعددی قرار داد، از جمله:
دنباله
خلوص
تمرکز
ترکیب حلال
pH
دما
قدرت یونی
شرایط نگهداری
مدل تجربی
به همین دلیل، مشاهدات به دست آمده در یک شرایط آزمایشی نباید به طور خودکار به سیستم دیگری تعمیم داده شود.
طراحی آزمایشی دقیق و خصوصیات تحلیلی مناسب هنگام تفسیر داده های تحقیقات پپتید ضروری است.
مواد ارائه شده توسط Cocer Peptides منحصراً برای تحقیقات آزمایشگاهی، تحقیقات تحلیلی و آزمایش های آزمایشگاهی در نظر گرفته شده است..
آنها برای تجویز انسانی یا دامپزشکی، مصرف، استفاده تشخیصی، استفاده درمانی، درمان یا پیشگیری از بیماری، یا هر کاربرد بالینی در نظر گرفته نشده اند.
اطلاعات ارائه شده در این وب سایت برای مرجع علمی و آموزشی در نظر گرفته شده است و نباید به عنوان توصیه پزشکی تفسیر شود.
این تمایز باید در کل وب سایت ثابت بماند. FDA مکرراً در اقدامات اخیر اجرای پپتید اعلام کرده است که عبارت 'فقط برای استفاده تحقیقاتی' محتوای دیگر وب سایت را تحت الشعاع قرار نمی دهد در صورتی که ادعاهای اطراف نشان دهنده استفاده از مواد مخدر برای انسان باشد.
