Pēc peptīdu informācijas 
2025. gada 1. maijā
VISI IZSTRĀDĀJUMI UN PRODUKTU INFORMĀCIJA ŠAJĀ VIETNE IR TIKAI INFORMĀCIJAS IZPLATĪŠANAI UN IZGLĪTĪBAS NOLŪKĀ.
Šajā tīmekļa vietnē sniegtie produkti ir paredzēti tikai in vitro pētījumiem. In vitro pētījumi (latīņu: *glāzē*, kas nozīmē stikla traukos) tiek veikti ārpus cilvēka ķermeņa. Šie produkti nav farmaceitiski izstrādājumi, tos nav apstiprinājusi ASV Pārtikas un zāļu pārvalde (FDA), un tos nedrīkst izmantot, lai novērstu, ārstētu vai izārstētu jebkādu medicīnisku stāvokli, slimības vai kaites. Ar likumu ir stingri aizliegts jebkādā veidā ievadīt šos produktus cilvēka vai dzīvnieka organismā.
Kas ir peptīds?
Termins 'peptīds' cēlies no grieķu vārda 'πέσσειν' (péssein), kas nozīmē 'sagremot'. Peptīds ir savienojums, ko veido aminoskābes, kas saistītas ar peptīdu saitēm. Peptīdu saites, kas ir amīda saites, rodas dehidratācijas kondensācijas rezultātā starp vienas aminoskābes α-karboksilgrupu un citas aminoskābes α-aminogrupu. Klasificēti pēc aminoskābju skaita, peptīdus ar 2 līdz 20 aminoskābēm sauc par oligopeptīdiem, tos ar 20 līdz 50 aminoskābēm sauc par polipeptīdiem, un sekvences, kas pārsniedz 50 aminoskābes ar specifiskām telpiskām struktūrām, parasti tiek klasificētas kā proteīni. Peptīdu molekulmasa parasti ir mazāka par 10 kDa. To primārā struktūra sastāv no lineāras aminoskābju secības, un daži peptīdi var veidot sekundāras struktūras, piemēram, α-spirāles. Peptīdi, kuriem piemīt dažādas funkcijas, ir plaši iesaistīti bioloģiskos procesos, tostarp signālu pārraidē, vielmaiņas regulēšanā un imūnās atbildes reakcijās, padarot tās par svarīgām biomolekulām gan ar strukturālu daudzveidību, gan bioloģisku funkcionalitāti lietojumos medicīnā, pārtikas zinātnē un citās jomās.
Kā veidojas peptīdi?
| Peptīdu veidošanās notiek, saistot aminoskābes, izmantojot peptīdu saites, kas notiek dabiski in vivo vai mākslīgi in vitro. Bioloģiskās sistēmās ribosomu sintēze ietver mRNS, kas nes ģenētisko informāciju, lai virzītu ribosomas, sakārtojot aktivētās aminoskābes noteiktā secībā. Pārneses RNS (tRNS) nogādā aminoskābes ribosomā, kur fermentatīvā katalīze veicina dehidratācijas kondensāciju starp vienas aminoskābes α-karboksilgrupu un citas aminoskābes α-aminogrupu, veidojot amīda (peptīda) saiti un atbrīvojot ūdens molekulu; šis process atkārtojas, lai radītu oligopeptīdus vai polipeptīdus. Neribosomu sintēze balstās uz specializētiem enzīmu kompleksiem, piemēram, peptīdu sintetāzēm, ko parasti novēro mikroorganismos, kas ražo bioaktīvos peptīdus, piemēram, antibiotikas. In vitro sintēze galvenokārt izmanto cietās fāzes peptīdu sintēzi (SPPS), kur aizsargātās aminoskābes tiek secīgi savienotas ar sveķu nesēju; deprotekcijas un kondensācijas reakcijas pakāpeniski pagarina peptīdu ķēdi. Alternatīvi mērķa peptīdus var iegūt, izmantojot dabisko proteīnu fermentatīvo hidrolīzi. Peptīdu saites veidošanās ir kovalentās saites process, kas kalpo par galveno saiti peptīdu un proteīnu primārajā struktūrā. Sīkāka informācija par peptīdu saitēm ir apskatīta sadaļā 'Peptīdu saites'. |  |
Peptīdu nomenklatūra
Peptīdu nomenklatūra parasti izriet no tajos esošo aminoskābju skaita, ievērojot vienošanos 'skaitlis + peptīds'. Piemēram, dipeptīds satur divas aminoskābes, tripeptīds trīs, un tas turpinās līdz dekapeptīdam ar desmit aminoskābēm. Peptīdi ar vairāk nekā desmit aminoskābēm tiek tieši nosaukti kā '11 - peptīds', '20 - peptīds' utt. Šī nosaukšanas sistēma parasti attiecas uz parastajiem lineārajiem peptīdiem, kas savienoti ar α - peptīdu saitēm. Tomēr pastāv izņēmumi:
Daži cikliskie peptīdi, piemēram, ciklosporīns un gramicidīns, ir nosaukti ar prefiksu 'cyclo -' vai patentētu nosaukumu savienojuma no galvas līdz asti vai sānu ķēdes ciklizācijas dēļ, un tie var saturēt nedabiskus komponentus, piemēram, D-aminoskābes.
Peptīdi ar unikālu savienojamību, piemēram, glutations, kam ir 'γ-peptīdu saite', kas veidojas starp γ-karboksilgrupu un α-aminogrupu, neatbilst lineārajai α-peptīdu saišu numerācijas konvencijai.
Funkcionālie peptīdi, piemēram, pretmikrobu līdzekļi un neiropeptīdi, tiek nosaukti, pamatojoties uz to bioloģiskajām funkcijām, nevis aminoskābju skaitu. Piemēram, mellitīns, pretmikrobu peptīds ar 26 aminoskābēm.
Mikroorganismu peptīdi, kas nesintezēti ribosomu ceļā, piemēram, bacitracīns un aktinomicīns, satur modificētas aminoskābes (piemēram, metilētas vai ciklizētas) un ir nosauktas pēc to avota vai funkcijas, ņemot vērā to unikālos biosintēzes ceļus, nevis aminoskābju skaitu.
Kopumā šie izņēmumi atspoguļo peptīdu nomenklatūras dažādo raksturu, kurā jāņem vērā strukturālās iezīmes, sintētiskie ceļi un funkcionālās īpašības.
Peptīdu klasifikācija
Peptīdus var iedalīt vairākās kategorijās:
Pēc aminoskābju skaita oligopeptīdi, kas sastāv no 2-20 peptīdiem, piemēram, dipeptīds un glutations, ir ļoti aktīvi; polipeptīdi ar 20-50 peptīdiem var veidot vienkāršas telpiskas struktūras, piemēram, insulīnogēna fragmentus; peptīdus ar vairāk nekā 50 peptīdiem un sarežģītām funkcijām parasti klasificē kā proteīnus, piemēram, insulīnu, kas satur 51 aminoskābi.
Pēc ķīmiskās struktūras lineārie peptīdi ir saistīti ar α-peptīdu saitēm, piemēram, enkefalīnu, cikliskie peptīdi veido gredzenu caur pirmo un pēdējo asti vai sānu ķēdi, piemēram, ciklosporīns, modificētie peptīdi satur nedabiskus komponentus, piemēram, aktinomicīna D-aminoskābes, un īpaši saistītie peptīdi ir saistīti ar glutathionu.
Pēc sintēzes veida ribosomu sintētiskos peptīdus kodē tādi gēni kā endorfīni, neribosomālie sintētiskie peptīdi ir atkarīgi no mikrobu enzīmu kompleksiem, piemēram, mikopeptīdiem, un sintētiskos peptīdus sagatavo ar ķīmiskiem vai bioloģiskiem līdzekļiem, piemēram, medicīnisko oktreotīdu.
Pēc funkcijas signālpeptīdi ir iesaistīti transmisijā, piemēram, tirotropīnu atbrīvojošais hormons, antibakteriālie peptīdi iznīcina baktēriju membrānas, piemēram, bišu indes peptīdus, neiropeptīdi regulē nervus, piemēram, endorfīnus atsāpināšanai, un ir arī ārstnieciskie peptīdi un funkcionālie pārtikas peptīdi.
Pēc avota dabiskie peptīdi eksistē organismos vai pārtikā, piemēram, piena kazeīna peptīdi, un sintētiskie peptīdi, mākslīgi iejaucoties, pārvar dabiskos ierobežojumus, piemēram, kosmētiskie oligopeptīdi.
Pēc bioloģiskiem avotiem tos var iedalīt dzīvnieku avotos, piemēram, tenzīnā, augu avotos, piemēram, sojas pupu peptīdos, un mikrobu avotos, piemēram, Mycobacterium avium peptīdos.
Šīs klasifikācijas savijas, lai atspoguļotu peptīdu bagātīgo daudzveidību struktūrā, funkcijās un pielietojumā.
Svarīgi termini, kas saistīti ar peptīdiem
Peptīdu saite: amīda saite -CO-NH-, kas veidojas vienas aminoskābes α-karboksigrupas dehidratācijas kondensācijā ar citas aminoskābes α-aminogrupu, kas ir pamata kovalentā saite, kas savieno aminoskābju atlikumus un veido peptīdus un proteīnus.
Oligopeptīds: parasti attiecas uz zemas molekulmasas peptīdu savienojumiem, piemēram, dipeptīdu, tripeptīdu utt., Kas veidojas, savienojot 2-20 aminoskābes caur peptīdu saiti, un kuriem ir augsta bioloģiskā aktivitāte un šūnu membrānas caurlaidība.
Polipeptīds: peptīds, kas sastāv no 20-50 aminoskābēm, molekulmasa parasti ir mazāka par 10 kDa, var veidot vienkāršu telpisku struktūru, piemēram, α-spirāli, ir funkcionāla molekula starp oligopeptīdu un proteīnu.
Primārā struktūra: peptīda aminoskābju secība, ko nosaka ģenētiskā informācija vai mākslīgais dizains, ir peptīda ķīmiskā pamatstruktūra, kas tieši ietekmē tā progresīvo struktūru un bioloģisko funkciju.
Sekundārā struktūra: sakārtota konformācija, ko veido ūdeņraža saite peptīdu ķēdes lokālajā apgabalā, piemēram, α-spirāle, β-locīšana, β-virpošana utt., kas nav tik stabila kā olbaltumvielām, bet ir iesaistīta funkcionālo vietu veidošanā.
Cikliskie peptīdi: peptīdi, kas veido ciklisku struktūru, savienojot pirmo un pēdējo aminoskābi vai sānu ķēdes grupas, piemēram, ciklosporīnu un īso peptīdu, ar augstu stabilitāti un anti-enzimatiskām īpašībām, bieži vien nosaukumā satur prefiksu 'ciklisks'.
Ribosomu sintezēti peptīdi: peptīdi, ko sintezē dzīvo organismu ribosomas, izmantojot mRNS veidnes translāciju, un to sekvences kodē gēni, piemēram, hormons insulīns un neirotransmitera endorfīns.
Neribosomālie sintētiskie peptīdi: peptīdi, ko sintezē īpaši enzīmu kompleksi, piemēram, peptīdu sintetāzes, kas parasti atrodami mikroorganismos, piemēram, baktērijās un sēnēs, un var saturēt nedabiskas aminoskābes, piemēram, D-aminoskābes, piemēram, antibiotiku Mycobacterium avium peptīdu.
Cietās fāzes peptīdu sintēze (SPPS): mākslīgās peptīdu sintēzes tehnoloģija in vitro, secīgi savienojot aizsargātās aminoskābes uz sveķu nesēja, izmantojot aizsardzības noņemšanas un kondensācijas reakciju, lai pakāpeniski pagarinātu peptīdu ķēdi, piemērota īsai peptīdu sintēzes precizitātei.
