Peptidoen informazioaren arabera 
, 2025eko maiatzaren 1a
WEB GUNE HONETAN EMATEN DITUZTEN ARTIKULU ETA PRODUKTUEN INFORMAZIO GUZTIAK INFORMAZIOA HABALTZEKO ETA HEZKUNTZA HELBURUKO BAKARRIK DIRA.
Webgune honetan eskaintzen diren produktuak in vitro ikerketarako soilik dira. In vitro ikerketa (latinez: *in glass*, beira-ontzietan esanahia) giza gorputzetik kanpo egiten da. Produktu hauek ez dira farmazia, ez ditu AEBko Elikagaien eta Droga Administrazioak (FDA) onartu eta ez dira erabili behar gaixotasun, gaixotasun edo gaixotasunik saihesteko, tratatzeko edo sendatzeko. Legeak erabat debekatuta dago produktu horiek gizakien edo animalien gorputzean edozein modutan sartzea.
Zer da Peptido bat?
'Peptido' terminoa grezierazko 'πέσσειν' (péssein) hitzetik du jatorria, 'digeritzea' esan nahi duena. Peptidoa lotura peptidikoen bidez loturiko aminoazidoek osatutako konposatua da. Lotura peptidikoak, amidazko loturak, aminoazido baten α-karboxilo taldearen eta beste baten α-amino taldearen arteko deshidratazio-kondentsaziotik sortzen dira. Aminoazido kopuruaren arabera sailkatuta, 2 eta 20 aminoazido dituzten peptidoei oligopeptido deitzen zaie, 20 eta 50 bitartekoei polipeptidoak dira, eta egitura espazial zehatzeko 50 aminoazido baino gehiago dituzten sekuentziak proteina gisa sailkatzen dira, oro har. Peptidoek normalean 10 kDa-tik beherako pisu molekularra dute. Haien egitura primarioa aminoazido sekuentzia lineal batez osatuta dago, eta peptido batzuek bigarren mailako egiturak sor ditzakete, hala nola α-helizeak. Askotariko funtzioak erakutsiz, peptidoek asko parte hartzen dute prozesu biologikoetan, besteak beste, seinaleen transdukzioa, erregulazio metabolikoa eta erantzun immunologikoak, eta biomolekula garrantzitsuak bihurtzen dituzte medikuntzan, elikagaien zientzian eta beste alor batzuetako aplikazioetan egitura aniztasunarekin eta funtzio biologikoarekin.
Nola sortzen dira peptidoak?
| Peptidoen eraketa aminoazidoen lotura peptidikoen bidez gertatzen da, modu naturalean in vivo edo artifizialki in vitro gertatzen da. Sistema biologikoetan, erribosomaren sintesian mRNAk informazio genetikoa eramatea dakar erribosomak zuzentzeko, aminoazido aktibatuak sekuentzia zehatz batean antolatzeko. Transferitzeko RNAek (tRNA) aminoazidoak ematen dizkiote erribosomara, non katalisi entzimatikoak deshidratazio-kondentsazioa eragiten duen aminoazido baten α-karboxilo taldearen eta beste baten α-amino taldearen artean, amida (peptido) lotura bat osatuz eta ur molekula bat askatuz; prozesu hori errepikatzen da oligopeptidoak edo polipeptidoak sortzeko. Sintesi ez-ribosomala entzima-konplexu espezializatuetan oinarritzen da, peptido-sintetasak, esaterako, antibiotikoak bezalako peptido bioaktiboak ekoizten dituzten mikroorganismoetan ikusi ohi direnak. In vitro sintesiak batez ere fase solidoko peptidoen sintesia (SPPS) erabiltzen du, non babestutako aminoazidoak sekuentzialki erretxina euskarri bati lotzen diren; desprotekzio- eta kondentsazio-erreakzioek peptido-katea mailaka hedatzen dute. Bestela, xede-peptidoak proteina naturalen hidrolisi entzimatikoaren bidez lor daitezke. Lotura peptidoen eraketak lotura kobalente-prozesu bat adierazten du, peptidoen eta proteinen egitura nagusiaren oinarrizko lotura gisa balio duena. Lotura peptidikoei buruzko xehetasun gehiago 'Lotura peptidikoak' atalean eztabaidatzen dira. |  |
Peptidoen nomenklatura
Peptidoen nomenklatura normalean duten aminoazido kopurutik dator, 'zenbakia + peptido\' konbentzioa jarraituz. Esate baterako, dipeptido batek bi aminoazido ditu, hiru tripeptido batek, eta honek hamar aminoazido dituen dekapeptido batera jarraitzen du. Hamar aminoazido baino gehiago dituzten peptidoek zuzenean '11 - peptido', '20 - peptido', etab gisa izendatzen dituzte. Izen-sistema hau, oro har, α - peptido loturen bidez konektatutako peptido lineal konbentzionalei aplikatzen zaie. Hala ere, salbuespenak daude:
Peptido zikliko batzuk, ziklosporina eta gramicidina, adibidez, 'cyclo -' aurrizkiarekin edo jabedun izen batekin izendatzen dira, burutik buztanera arteko loturagatik edo alboko katearen ziklikapenagatik, eta D-aminoazidoak bezalako osagai ez-naturalak izan ditzakete.
Konektibitate berezia duten peptidoek, adibidez, glutationa, γ-karboxilo taldearen eta α-amino taldearen artean eratutako 'γ-peptido lotura' duena, ez dute α-peptido loturaren zenbakitze-konbentzio lineala jarraitzen.
Peptido funtzionalak, hala nola, mikrobioen aurkakoak eta neuropeptidoak, beren funtzio biologikoen arabera izendatzen dira aminoazidoen zenbaketa baino. Adibidez, mellitina, 26 aminoazido dituen mikrobioen aurkako peptidoa.
Mikroorganismoetatik sintetizatzen ez diren peptidoek, bazitrazina eta aktinomizina, esaterako, aminoazido eraldatuak dituzte (adibidez, metilizatuak edo ziklikatuak) eta haien jatorria edo funtzioaren izendapena dute beren biosintetiko bide bereziagatik, aminoazidoen zenbaketa baino gehiago.
Laburbilduz, salbuespen hauek peptidoen nomenklaturaren izaera anitza islatzen dute, egiturazko ezaugarriak, ibilbide sintetikoak eta ezaugarri funtzionalak kontuan hartu behar dituena.
Peptidoen sailkapena
Peptidoak hainbat dimentsiotan sailka daitezke:
Aminoazido kopuruaren arabera, dipeptidoa eta glutationa bezalako 2-20 peptidoz osatutako oligopeptidoak oso aktibo daude; 20-50 peptido dituzten polipeptidoek egitura espazial sinpleak sor ditzakete, hala nola intsulinogeno zatiak; 50 peptido eta funtzio konplexu baino gehiago dituzten peptidoak proteina gisa sailkatu ohi dira, adibidez, 51 aminoazido dituen intsulina.
Egitura kimikoaren arabera, peptido linealak α-peptido loturen bidez lotzen dira, hala nola enkefalina, peptido ziklikoek eraztun bat osatzen dute lehenengo eta azken isatsean edo alboko katearen bidez, hala nola ziklosporinan, eraldatutako peptidoek osagai ez-naturalak dituzte, hala nola aktinomizinaren D-aminoazidoak, eta bereziki loturiko peptidoak, hala nola, glutatioa γ peptidoekin lotzen dira.
Sintesi-moduaren arabera, endorfinak bezalako geneek kodetzen dituzte peptido erribosomiko sintetikoak, peptido sintetiko ez-erribosomikoak mikopeptidoen bezalako entzima konplexuen menpe daude eta peptido sintetikoak bitarteko kimiko edo biologikoen bidez prestatzen dira, hala nola octreotide sendagarriak.
Funtzioaren arabera, seinaleztapen-peptidoek transmisioan parte hartzen dute, hala nola tirotropina askatzeko hormona, bakterioen aurkako peptidoek bakterio-mintzak suntsitzen dituzte, hala nola erleen pozoiaren peptidoak, neuropeptidoek nerbioak erregulatzen dituzte, hala nola endorfinak analgesirako, eta peptido sendagarriak eta elikagai funtzionalak ere badaude.
Iturriaren arabera, peptido naturalak daude organismoetan edo elikagaietan, hala nola esnekien kaseina peptidoak, eta peptido sintetikoek muga naturalak gainditzen dituzte esku-hartze artifizialaren bidez, hala nola oligopeptido kosmetikoen bidez.
Iturri biologikoen arabera, animalia-iturrietan sailkatu daitezke, hala nola tentsina, landare-iturri, hala nola soja-peptidoak, eta mikrobio-iturri, hala nola Mycobacterium avium peptidoak.
Sailkapen hauek nahasten dira egitura, funtzio eta aplikazioan peptidoen aniztasun aberatsa islatzeko.
Peptidoekin lotutako termino garrantzitsuak
Lotura peptidikoa: -CO-NH- aminoazido baten α-karboxi-taldearen beste aminoazido baten α-amino taldearekin kondentsatzean sortzen den amida-lotura, hau da, aminoazido-hondarrak lotzen dituen eta peptidoak eta proteinak osatzen dituen oinarrizko lotura kobalentea.
Oligopeptidoa: normalean pisu molekular baxuko peptido konposatuei egiten die erreferentzia, hala nola dipeptidoa, tripeptidoa, etab., lotura peptidikoaren bidez 2-20 aminoazido lotuz eratzen direnak eta jarduera biologiko handia eta zelula-mintzaren iragazkortasuna dutenak.
Polipeptidoa: 20-50 aminoazidoz osatutako peptidoa, pisu molekularra 10 kDa baino txikiagoa izan ohi da, α-helix bezalako egitura espazial sinplea osa dezake, oligopeptidoaren eta proteinaren arteko molekula funtzionala da.
Egitura primarioa: peptidoaren aminoazidoen sekuentzia, informazio genetikoaren edo diseinu artifizialaren arabera zehazten dena, peptidoaren oinarrizko egitura kimikoa da, eta horrek zuzenean eragiten dio bere egitura aurreratuari eta funtzio biologikoari.
Egitura sekundarioa: kate peptidikoaren tokiko eremuan hidrogeno-loturak eratzen duen konformazio ordenatua, hala nola α-helizea, β-tolestura, β-bihurketa, etab., proteinak bezain egonkorra ez dena, baina gune funtzionalen eraketan parte hartzen duena.
Peptido ziklikoak: lehenengo eta azken aminoazidoak edo alboko kate-taldeak lotuz egitura ziklikoa osatzen duten peptidoak, hala nola, ziklosporina eta peptido laburra, egonkortasun handiko eta ezaugarri anti-entzimatikoekin, askotan 'ziklikoa' aurrizkia dutelarik izenan.
Erribosomak sintetizatutako peptidoak: izaki bizidunen erribosomek mRNA txantiloiaren itzulpenaren bidez sintetizatzen dituzten peptidoak, eta haien sekuentziak geneek kodetzen dituzte, hala nola hormona intsulina eta neurotransmisore endorfina.
Peptido sintetiko ez-ribosomikoak: entzima-konplexu bereziek sintetizatutako peptidoak, hala nola peptido sintetasak, mikroorganismoetan aurkitu ohi direnak, hala nola bakterioak eta onddoak, eta aminoazido ez-naturalak izan ditzakete, hala nola D-aminoazidoak, adibidez, Mycobacterium avium peptidoa antibiotikoa.
Fase Solidoko Peptidoen Sintesia (SPPS): In vitro peptido artifizialaren sintesia teknologia, erretxina-eramailearen babestutako aminoazidoen akoplamendu sekuentzialaren bidez, desprotekzioaren bidez, kondentsazio-erreakzioa peptido-katea pixkanaka zabaltzeko, peptido-sintesiaren zehaztasun laburrerako egokia.
