Per Peptide Information 
1 di Maghju di u 2025
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Cosa hè un Peptide?
U terminu 'peptide' hè urigginatu da a parola greca 'πέσσειν' (péssein), chì significa 'digerirà'. I legami peptidici, chì sò legami amidi, nascenu da a condensazione di disidratazione trà u gruppu α-carboxyl di un aminoacidu è u gruppu α-amino di un altru. Classificati per u numeru di aminoacidi, i peptidi cù 2 à 20 aminoacidi sò chjamati oligopeptidi, quelli cù 20 à 50 sò polipeptidi, è e sequenze chì superanu 50 aminoacidi cù strutture spaziali specifiche sò generalmente categurizzati cum'è proteini. I Peptidi sò tipicamente un pesu molekulari sottu à 10 kDa. A so struttura primaria hè custituita da una sequenza d'aminoacidi lineari, è certi peptidi ponu formate strutture secondarie cum'è α-hélices. Esibendo diverse funzioni, i peptidi sò largamente implicati in i prucessi biologichi cumpresi a trasduzione di signali, a regulazione metabolica è e risposte immunitarie, rendendu biomolecule impurtanti cù a diversità strutturale è a funziunalità biologica in applicazioni in medicina, scienza di l'alimentariu è altri campi.
Cumu si formanu i Peptidi?
| A furmazione di peptidi si trova per via di u ligame di l'aminoacidi via ligami peptidi, chì si trovanu naturali in vivo o artificialmente in vitro. In i sistemi biologichi, a sintesi ribosomiale implica l'ARNm chì porta l'infurmazione genetica à i ribosomi diretti in l'arrangiamentu di l'aminoacidi attivati in una sequenza specifica. L'RNA di trasferimentu (tRNAs) furnisce l'aminoacidi à u ribosoma, induve a catalisi enzimatica conduce a condensazione di disidratazione trà u gruppu α-carboxyl di un aminoacidu è u gruppu α-amino di l'altru, furmendu un ligame amide (peptide) è liberando una molécula d'acqua; stu prucessu si ripete per generà oligopeptidi o polipeptidi. A sintesi non ribosomiale si basa in cumplessi enzimatici specializati cum'è sintetasi di peptidi, cumunamenti osservati in i microorganismi chì producono peptidi bioattivi cum'è l'antibiotici. A sintesi in vitro impiega principalmente a sintesi di peptide in fase solida (SPPS), induve l'aminoacidi protetti sò sequenzialmente accoppiati à un supportu di resina; riazzioni di deprotection è cundensazione allargate a catena peptide stepwise. In alternativa, i peptidi di destinazione ponu esse ottenuti via l'idrolisi enzimatica di e proteine naturali. A furmazione di ligami peptidi rapprisenta un prucessu di ligame covalente, chì serve cum'è u core linkage in a struttura primaria di peptidi è proteini. Ulteriori dettagli nantu à i ligami peptidi sò discututi in a sezione 'Ligami peptidi'. |  |
Nomenclatura di Peptidi
A nomenclatura di i peptidi deriva tipicamente da u numeru di aminoacidi chì cuntenenu, secondu a cunvenzione di 'numerale + peptide'. Per esempiu, un dipeptide comprende dui aminoacidi, un tripeptide trè, è questu cuntinueghja finu à un decapeptide cù deci aminoacidi. Peptidi cù più di deci aminoacidi sò direttamente chjamati '11 - peptide', '20 - peptide', etc. Stu sistema di nomenamentu hè generalmente appiicatu à i peptidi lineari cunvinziunali cunnessi da ligami α - peptidi. Tuttavia, ci sò eccezzioni:
Certi peptidi ciclichi, cum'è a ciclosporina è a gramicidina, sò chjamati cù un prefissu 'cyclo -' o un nome patentatu per via di a cunnessione di a testa à a cuda o di a ciclisazione di a catena laterale, è ponu cuntene cumpunenti non naturali cum'è D-aminoacidi.
Peptidi cù una connettività unica, cum'è u glutathione, chì hà un 'legame γ-peptide' furmatu trà u gruppu γ-carboxyl è u gruppu α-amino, ùn seguitanu micca a cunvenzione di numerazione lineare α-peptide.
I peptidi funzionali, cum'è l'antimicrobiali è i neuropeptidi, sò chjamati in basa di e so funzioni biologiche piuttostu cà u numeru di aminoacidi. Per esempiu, mellitin, un peptide antimicrobicu cù 26 aminoacidi.
I peptidi sintetizzati non ribosomiali da i microorganismi, cum'è a bacitracina è l'actinomicina, cuntenenu aminoacidi mudificati (per esempiu, methylated o cyclized) è sò chjamati dopu à a so fonte o funzione per via di i so viaghji biosintetici unichi, piuttostu cà u numeru di aminoacidi.
In riassuntu, queste eccezzioni riflette a natura diversa di a nomenclatura di peptide, chì deve piglià in contu e caratteristiche strutturali, rotte sintetiche è caratteristiche funziunali.
Classificazione di peptidi
I peptidi ponu esse categurizzati in parechje dimensioni:
Per u numeru di aminoacidi, oligopeptidi custituiti da peptidi 2-20, cum'è dipeptide è glutathione, sò assai attivi; i polipeptidi cù 20-50 peptidi ponu formate strutture spaziali simplici cum'è frammenti insulinogenu; peptidi cù più di 50 peptidi è funzioni cumplessi sò generalmente categurizzati cum'è proteini, cum'è l'insulina chì cuntene 51 aminoacidi.
Per struttura chimica, i peptidi lineari sò ligati da legami α-peptidi cum'è l'enkefalina, i peptidi ciclichi formanu un anellu à traversu a prima è l'ultima coda o catena laterale cum'è a ciclosporina, i peptidi modificati cuntenenu cumpunenti innaturali cum'è l'aminoacidi D di l'actinomicina, è i peptidi ligati in particulare cum'è glutathione-γ sò peptidi ligati da glutathione.
Per modu di sintesi, i peptidi sintetici ribosomiali sò codificati da genesi cum'è l'endorfine, i peptidi sintetici non-ribosomali dipendenu da i cumplessi di l'enzimi microbiali cum'è i micopeptidi, è i peptidi sintetici sò preparati per mezu chimicu o biologicu cum'è octreotide medicinali.
Per funzione, i peptidi di signalazione sò implicati in a trasmissione cum'è l'hormone di liberazione di tireotropina, i peptidi antibacterial distrughjenu e membrani batteriche cum'è i peptidi di velenu d'api, i neuropeptidi regulanu i nervi cum'è l'endorfine per l'analgesia, è ci sò ancu peptidi medicinali è peptidi funziunali di l'alimentu.
Per surghjente, i peptidi naturali esistenu in l'organisimi o l'alimentariu, cum'è i peptidi di caseina di latti, è i peptidi sintetici rompenu i limitazioni naturali per l'intervenzione artificiale, cum'è l'oligopeptidi cusmetichi.
Per fonti biologichi, ponu esse categurizzati in fonti animali cum'è tensin, fonti vegetali cum'è peptidi di soia, è fonti microbiche cum'è Mycobacterium avium peptides.
Queste classificazioni si intreccianu per riflette a ricca diversità di peptidi in struttura, funzione è applicazione.
Termini impurtanti ligati à i peptidi
Peptide bond: U ligame amide -CO-NH- furmatu da a cundensazione di disidratazione di u gruppu α-carboxy di un aminoacidu cù u gruppu α-amino di un altru aminoacidu, chì hè u ligame covalente basicu chì cunnetta i residui di aminoacidu è custituiscenu peptidi è proteine.
Oligopeptide: di solitu si riferisce à composti di peptide di pesu molekulari bassu, cum'è dipeptide, tripeptide, etc., chì sò furmati da a cunnessione di 2-20 aminoacidi à traversu peptide, è anu una alta attività biologica è permeabilità di a membrana cellulare.
Polypeptide: peptide cumpostu da 20-50 aminoacidi, u pesu molekulari hè di solitu menu di 10 kDa, pò furmà una struttura spaziale simplice cum'è α-helix, hè una molècula funziunale trà oligopeptide è proteina.
Struttura primaria: a sequenza di aminoacidi di peptide, determinata da infurmazione genetica o design artificiale, hè a struttura chimica basica di peptide, chì affetta direttamente a so struttura avanzata è a funzione biologica.
Struttura secundaria: a conformazione urdinata formata da ligami di l'idrogenu in l'area lucale di a catena peptidica, cum'è α-helix, β-folding, β-turning, etc., chì ùn hè micca stabile cum'è quella di i proteini, ma hè implicatu in a furmazione di siti funziunali.
Peptidi ciclichi: peptidi chì formanu una struttura ciclica cunghjuntendu u primu è l'ultimu aminoacidi o gruppi di catene laterali, cum'è ciclosporina è peptide corta, cù alta stabilità è caratteristiche anti-enzimatiche, spessu cuntenenu u prefissu 'ciclicu' in u nome.
Peptidi sintetizzati ribosomi: peptidi sintetizzati da i ribosomi di l'organismi viventi attraversu a traduzzione di mudelli di mRNA, è e so sequenze sò codificate da geni, cum'è l'hormone insulina è l'endorfina neurotransmitter.
Peptidi sintetici non ribosomiali: peptidi sintetizzati da complexi enzimatici spiciali, cum'è sintetasi di peptidi, cumunimenti truvati in microorganismi cum'è battìri è fungi, è ponu cuntene aminoacidi innaturali cum'è D-aminoacidi, per esempiu, l'antibioticu Mycobacterium avium peptide.
Solid Phase Peptide Synthesis (SPPS): Tecnulugia di sintesi di peptide artificiale in vitro, attraversu l'accoppiamentu sequenziale di aminoacidi prutetti nantu à u trasportatore di resina, attraversu a deprotection, a reazione di condensazione per allargà gradualmente a catena di peptide, adattata per a precisione di sintesi di peptide corta.
