De Peptida Informo 
la 1-an de majo 2025
ĈIUJ ARTIKOLOJ KAJ PRODUCTINFORMOJ PROVIZITAJ EN ĈI TIU RETEJO ESTAS NUR POR INFORMA DISVASO KAJ EDUKAJ CELO.
La produktoj provizitaj en ĉi tiu retejo estas destinitaj ekskluzive por in vitro esplorado. En vitro esploro (latine: *en vitro*, signifante en vitrovaro) estas farita ekster la homa korpo. Ĉi tiuj produktoj ne estas farmaciaĵoj, ne estis aprobitaj de la Usona Administracio pri Manĝaĵoj kaj Medikamentoj (FDA), kaj ne devas esti uzataj por malhelpi, trakti aŭ kuraci ajnan malsanon, malsanon aŭ malsanon. Estas strikte malpermesite per leĝo enkonduki ĉi tiujn produktojn en la homan aŭ bestan korpon en ajna formo.
Kio estas Peptido?
La termino 'peptido' devenas de la greka vorto 'πέσσειν' (péssein), kun la signifo 'digesti.' Peptido estas kunmetaĵo formita de aminoacidoj ligitaj per peptidaj ligoj. Peptidaj ligoj, kiuj estas amidaj ligoj, ekestiĝas de la dehidratigkondensado inter la α-karboksilgrupo de unu aminoacido kaj la α-aminogrupo de alia. Klasifikitaj laŭ aminoacido-kalkulo, peptidoj kun 2 ĝis 20 aminoacidoj estas nomitaj oligopeptidoj, tiuj kun 20 ĝis 50 estas polipeptidoj, kaj sekvencoj superantaj 50 aminoacidoj kun specifaj spacaj strukturoj estas ĝenerale kategoriitaj kiel proteinoj. Peptidoj tipe havas molekulpezon sub 10 kDa. Ilia primara strukturo konsistas el lineara aminoacidsekvenco, kaj kelkaj peptidoj povas formi sekundarajn strukturojn kiel ekzemple α-helicoj. Montrante diversajn funkciojn, peptidoj estas vaste implikitaj en biologiaj procezoj inkluzive de signaltransdukto, metabola reguligo kaj imunreagoj, igante ilin gravaj biomolekuloj kun kaj struktura diverseco kaj biologia funkcieco en aplikoj tra medicino, nutraĵscienco, kaj aliaj kampoj.
Kiel Formiĝas Peptidoj?
| Peptidformacio okazas tra la ligo de aminoacidoj per peptidaj ligoj, okazante nature en vivo aŭ artefarite in vitro. En biologiaj sistemoj, ribosoma sintezo implikas mRNA portantan genetikajn informojn por direkti ribosomojn en aranĝado de aktivigitaj aminoacidoj en specifa sekvenco. Transiga RNAoj (tRNA) liveras aminoacidojn al la ribosomo, kie enzimeca katalizo movas dehidratigkondensadon inter la α-karboksilgrupo de unu aminoacido kaj la α-aminogrupo de alia, formante amida (peptido) ligon kaj liberigante akvomolekulon; ĉi tiu procezo ripetas por generi oligopeptidojn aŭ polipeptidojn. Ne-ribosoma sintezo dependas de specialecaj enzimkompleksoj kiel peptidsintezazoj, ofte observitaj en mikroorganismoj produktantaj bioaktivajn peptidojn kiel ekzemple antibiotikoj. En vitra sintezo ĉefe utiligas solid-fazan peptidsintezon (SPPS), kie protektitaj aminoacidoj estas sinsekve kunligitaj al rezina subteno; malprotekto kaj kondensaj reagoj etendas la peptidĉenon laŭpaŝe. Alternative, celpeptidoj povas esti akiritaj per enzimeca hidrolizo de naturaj proteinoj. Peptida ligoformado reprezentas kovalentan ligan procezon, funkciante kiel la kernligo en la primara strukturo de peptidoj kaj proteinoj. Pliaj detaloj pri peptidaj ligoj estas diskutitaj en la sekcio 'Peptidaj ligoj.' |  |
Nomenklaturo de Peptidoj
La nomenklaturo de peptidoj tipe venas de la nombro da aminoacidoj kiujn ili enhavas, sekvante la konvencion de 'numera + peptido'. Ekzemple, dipeptido konsistas el du aminoacidoj, el tripeptido tri, kaj tio daŭras ĝis dekapeptido kun dek aminoacidoj. Peptidoj kun pli ol dek aminoacidoj estas rekte nomitaj kiel '11 - peptido', '20 - peptido', ktp. Ĉi tiu nomsistemo ĝenerale validas por konvenciaj linearaj peptidoj ligitaj per α - peptidaj ligoj. Tamen ekzistas esceptoj:
Kelkaj ciklaj peptidoj, kiel ekzemple ciklosporino kaj gramicidino, estas nomitaj kun 'ciklo -' prefikso aŭ proprieta nomo pro kap-al-vosta ligo aŭ flanka -ĉena cikligo, kaj povas enhavi nenaturajn komponentojn kiel D-aminoacidoj.
Peptidoj kun unika konektebleco, kiel glutationo, kiu havas 'γ-peptidan ligon' formitan inter la γ-karboksila grupo kaj la α-amino-grupo, ne sekvas la linearan α-peptidan ligon numeran konvencion.
Funkciaj peptidoj, kiel ekzemple antimikrobaj kaj neŭropeptidoj, estas nomitaj surbaze de siaj biologiaj funkcioj prefere ol aminoacidkalkulo. Ekzemple, mellitino, kontraŭmikroba peptido kun 26 aminoacidoj.
Ne-ribosome sintezitaj peptidoj de mikroorganismoj, kiel ekzemple bacitracino kaj aktinomicino, enhavas modifitajn aminoacidojn (ekz., metiligitajn aŭ ciklizitajn) kaj estas nomitaj laŭ sia fonto aŭ funkcio pro siaj unikaj biosintezaj padoj, prefere ol aminoacidkalkulo.
En resumo, tiuj esceptoj reflektas la varian naturon de peptidnomenklaturo, kiu devas enkalkuli strukturajn ecojn, sintezajn itinerojn kaj funkciajn karakterizaĵojn.
Klasifiko de peptidoj
Peptidoj povas esti klasifikitaj en multoblaj dimensioj:
Laŭ la nombro da aminoacidoj, oligopeptidoj konsistantaj el 2-20 peptidoj kiel ekzemple dipeptido kaj glutationo estas tre aktivaj; polipeptidoj kun 20-50 peptidoj povas formi simplajn spacajn strukturojn kiel ekzemple insulinogenaj fragmentoj; peptidoj kun pli ol 50 peptidoj kaj kompleksaj funkcioj estas kutime klasifikitaj kiel proteinoj, kiel ekzemple insulino kiu enhavas 51 aminoacidojn.
Laŭ kemia strukturo, liniaj peptidoj estas ligitaj per α-peptidaj ligoj kiel ekzemple enkefalino, ciklaj peptidoj formas ringon tra la unua kaj lasta vosto aŭ flanka ĉeno kiel ekzemple ciklosporino, modifitaj peptidoj enhavas nenaturajn komponentojn kiel ekzemple la D-aminoacidoj de aktinomicino, kaj speciale ligitaj peptidoj kiel ekzemple glutation-γ estas ligitaj peptidoj.
Laŭ reĝimo de sintezo, ribosomaj sintezaj peptidoj estas ĉifritaj per genoj kiel ekzemple endorfinoj, ne-ribosomaj sintezaj peptidoj estas dependaj de mikrobaj enzimkompleksoj kiel ekzemple mikopeptidoj, kaj sintezaj peptidoj estas preparitaj per kemiaj aŭ biologiaj rimedoj kiel ekzemple medikamenta oktreotido.
Laŭ funkcio, signalaj peptidoj estas implikitaj en transdono kiel tirotropin-liberiga hormono, kontraŭbakteriaj peptidoj detruas bakteriajn membranojn kiel ekzemple abelvenenpeptidoj, neŭropeptidoj reguligas nervojn kiel ekzemple endorfinoj por analgezio, kaj ekzistas ankaŭ kuracaj peptidoj kaj funkciaj manĝpeptidoj.
Laŭ fonto, naturaj peptidoj ekzistas en organismoj aŭ manĝaĵo, kiel ekzemple laktaĵkazeinpeptidoj, kaj sintezaj peptidoj trarompas naturajn limigojn per artefarita interveno, kiel ekzemple kosmetikaj oligopeptidoj.
Per biologiaj fontoj, ili povas esti klasifikitaj en bestajn fontojn kiel ekzemple tensin, plantfontojn kiel ekzemple sojfabpeptidoj, kaj mikrobaj fontoj kiel ekzemple Mycobacterium avium peptidoj.
Ĉi tiuj klasifikoj interplektiĝas por reflekti la riĉan diversecon de peptidoj en strukturo, funkcio kaj apliko.
Gravaj terminoj rilataj al peptidoj
Peptida ligo: La amida ligo -CO-NH- formita per la dehidratiĝokondensado de la α-karboksita grupo de unu aminoacido kun la α-aminogrupo de alia aminoacido, kiu estas la baza kovalenta ligo kunliganta aminoacidajn restaĵojn kaj konsistigante peptidojn kaj proteinojn.
Oligopeptido: kutime rilatas al malalta molekula pezo peptidaj komponaĵoj, kiel ekzemple dipeptido, tripeptido, ktp., kiuj estas formitaj per kunligo de 2-20 aminoacidoj per peptida ligo, kaj havas altan biologian aktivecon kaj ĉelmembran permeablon.
Polipeptido: peptido kunmetita de 20-50 aminoacidoj, molekula pezo estas kutime malpli ol 10 kDa, povas formi simplan spacan strukturon kiel α-helico, estas funkcia molekulo inter oligopeptido kaj proteino.
Primara strukturo: la aminoacida sekvenco de peptido, determinita de genetika informo aŭ artefarita dezajno, estas la baza kemia strukturo de peptido, kiu rekte influas ĝian altnivelan strukturon kaj biologian funkcion.
Malĉefa strukturo: la ordigita formo formita de hidrogena ligo en la loka areo de la peptida ĉeno, kiel α-helico, β-faldado, β-turniĝo, ktp., kiu ne estas tiel stabila kiel tiu de proteinoj, sed estas implikita en la formado de funkciaj lokoj.
Ciklaj peptidoj: peptidoj kiuj formas ciklan strukturon kunligante la unuajn kaj lastajn aminoacidojn aŭ flankajn ĉengrupojn, kiel ciklosporino kaj mallonga peptido, kun alta stabileco kaj kontraŭenzimaj trajtoj, ofte enhavantaj la prefikson 'cikla' en la nomo.
Ribosome sintezitaj peptidoj: peptidoj sintezitaj per la ribosomoj de vivantaj organismoj per mRNA-ŝablona tradukado, kaj iliaj sekvencoj estas ĉifritaj per genoj, kiel ekzemple la hormona insulino kaj la neŭrotransmitor endorfino.
Ne-ribosomaj sintezaj peptidoj: peptidoj sintezitaj per specialaj enzimkompleksoj kiel ekzemple peptidsintezazoj, ofte trovitaj en mikroorganismoj kiel ekzemple bakterioj kaj fungoj, kaj povas enhavi nenaturajn aminoacidojn kiel ekzemple D-aminoacidoj, ekz., la antibiotika Mycobacterium avium peptido.
Solida Faza Peptida Sintezo (SPPS): In vitro artefarita peptida sinteza teknologio, per la sinsekva kuplado de protektitaj aminoacidoj sur la rezina portanto, tra la malprotekto, kondensada reago por iom post iom etendi la peptidan ĉenon, taŭgan por mallonga peptida sinteza precizeco.
