Od informacija o peptidima 
1. maja 2025
SVI ČLANCI I INFORMACIJE O PROIZVODU DANE NA OVOM WEB SAJTU SU ISKLJUČIVO ZA ŠIRENJE INFORMACIJA I EDUKATIVNE SVRHE.
Proizvodi koji se nalaze na ovoj web stranici namijenjeni su isključivo za in vitro istraživanja. In vitro istraživanja (latinski: *u staklu*, što znači u staklenom posuđu) se provode izvan ljudskog tijela. Ovi proizvodi nisu farmaceutski proizvodi, nisu odobreni od strane US Food and Drug Administration (FDA) i ne smiju se koristiti za prevenciju, liječenje ili liječenje bilo kojeg medicinskog stanja, bolesti ili tegobe. Zakonom je strogo zabranjeno unošenje ovih proizvoda u ljudsko ili životinjsko tijelo u bilo kojem obliku.
Šta je peptid?
Izraz 'peptid' potiče od grčke riječi 'πέσσειν' (péssein), što znači 'svariti'. Peptid je spoj formiran od aminokiselina povezanih peptidnim vezama. Peptidne veze, koje su amidne veze, nastaju kondenzacijom dehidratacije između α-karboksilne grupe jedne amino kiseline i α-amino grupe druge. Klasifikovani prema broju aminokiselina, peptidi sa 2 do 20 aminokiselina nazivaju se oligopeptidi, oni sa 20 do 50 su polipeptidi, a sekvence koje prelaze 50 aminokiselina sa specifičnim prostornim strukturama se generalno kategorišu kao proteini. Peptidi obično imaju molekulsku težinu ispod 10 kDa. Njihova primarna struktura sastoji se od linearne sekvence aminokiselina, a neki peptidi mogu formirati sekundarne strukture poput α-heliksa. Pokazujući različite funkcije, peptidi su naširoko uključeni u biološke procese uključujući transdukciju signala, metaboličku regulaciju i imune odgovore, čineći ih važnim biomolekulima sa strukturnom raznolikošću i biološkom funkcionalnošću u primjenama u medicini, znanosti o hrani i drugim poljima.
Kako nastaju peptidi?
| Formiranje peptida se događa povezivanjem aminokiselina preko peptidnih veza, koje se odvija prirodno in vivo ili umjetno in vitro. U biološkim sistemima, ribosomska sinteza uključuje mRNA koja nosi genetske informacije da usmjeri ribozome u raspoređivanje aktiviranih aminokiselina u određenom nizu. Transfer RNA (tRNA) isporučuju aminokiseline u ribozom, gdje enzimska kataliza pokreće kondenzaciju dehidracije između α-karboksilne grupe jedne amino kiseline i α-amino grupe druge, formirajući amidnu (peptidnu) vezu i oslobađajući molekul vode; ovaj proces se ponavlja za stvaranje oligopeptida ili polipeptida. Neribosomalna sinteza se oslanja na specijalizirane enzimske komplekse poput peptidnih sintetaza, koje se obično primjećuju kod mikroorganizama koji proizvode bioaktivne peptide kao što su antibiotici. In vitro sinteza prvenstveno koristi sintezu peptida u čvrstoj fazi (SPPS), gdje se zaštićene aminokiseline uzastopno spajaju na podlogu od smole; reakcije uklanjanja zaštite i kondenzacije produžuju peptidni lanac postupno. Alternativno, ciljni peptidi se mogu dobiti enzimskom hidrolizom prirodnih proteina. Formiranje peptidne veze predstavlja kovalentni proces vezivanja, koji služi kao jezgra veze u primarnoj strukturi peptida i proteina. Dalji detalji o peptidnim vezama razmatraju se u odjeljku 'Peptidne veze'. |  |
Nomenklatura peptida
Nomenklatura peptida obično proizlazi iz broja aminokiselina koje sadrže, slijedeći konvenciju 'broj + peptid'. Na primjer, dipeptid se sastoji od dvije aminokiseline, tripeptida tri, a to se nastavlja do dekapeptida sa deset aminokiselina. Peptidi sa više od deset aminokiselina direktno se nazivaju '11 - peptid', '20 - peptid' itd. Ovaj sistem imenovanja se generalno primenjuje na konvencionalne linearne peptide povezane α - peptidnim vezama. Međutim, postoje izuzeci:
Neki ciklički peptidi, kao što su ciklosporin i gramicidin, nazivaju se prefiksom 'ciklo -' ili zaštićenim imenom zbog veze glava-rep ili ciklizacije bočnog lanca, a mogu sadržavati neprirodne komponente poput D-aminokiselina.
Peptidi sa jedinstvenom vezom, kao što je glutation, koji ima 'γ-peptidnu vezu' formiranu između γ-karboksilne grupe i α-amino grupe, ne prate konvenciju linearnog brojanja α-peptidnih veza.
Funkcionalni peptidi, kao što su antimikrobni i neuropeptidi, imenovani su na osnovu njihovih bioloških funkcija, a ne broja aminokiselina. Na primjer, melitin, antimikrobni peptid sa 26 aminokiselina.
Neribozomski sintetizirani peptidi iz mikroorganizama, kao što su bacitracin i aktinomicin, sadrže modificirane aminokiseline (npr. metilirane ili ciklizirane) i nazvani su prema njihovom izvoru ili funkciji zbog jedinstvenih puteva biosinteze, a ne broja aminokiselina.
Ukratko, ovi izuzeci odražavaju raznoliku prirodu nomenklature peptida, koja mora uzeti u obzir strukturne karakteristike, sintetičke puteve i funkcionalne karakteristike.
Klasifikacija peptida
Peptidi se mogu kategorizirati u više dimenzija:
Po broju aminokiselina, oligopeptidi koji se sastoje od 2-20 peptida kao što su dipeptid i glutation su visoko aktivni; polipeptidi sa 20-50 peptida mogu formirati jednostavne prostorne strukture kao što su fragmenti insulinogena; peptidi sa više od 50 peptida i složenim funkcijama obično se kategoriziraju kao proteini, kao što je inzulin koji sadrži 51 aminokiselinu.
Po hemijskoj strukturi, linearni peptidi su povezani α-peptidnim vezama kao što je enkefalin, ciklički peptidi formiraju prsten kroz prvi i poslednji rep ili bočni lanac kao što je ciklosporin, modifikovani peptidi sadrže neprirodne komponente kao što su D-aminokiseline aktinomicina, a posebno povezani peptidi kao što je peptid glutationa su vezani peptidi.
Po načinu sinteze, ribosomski sintetički peptidi su kodirani genima kao što su endorfini, neribosomski sintetički peptidi zavise od mikrobnih enzimskih kompleksa kao što su mikopeptidi, a sintetički peptidi se pripremaju hemijskim ili biološkim sredstvima kao što je medicinski oktreotid.
Po funkciji, signalni peptidi su uključeni u prijenos kao što je tirotropin-oslobađajući hormon, antibakterijski peptidi uništavaju bakterijske membrane kao što su peptidi pčelinjeg otrova, neuropeptidi regulišu živce poput endorfina za analgeziju, a postoje i medicinski peptidi i funkcionalni peptidi hrane.
Po izvoru, prirodni peptidi postoje u organizmima ili hrani, kao što su peptidi kazeina iz mlijeka, a sintetički peptidi probijaju prirodna ograničenja kroz umjetnu intervenciju, kao što su kozmetički oligopeptidi.
Prema biološkim izvorima, mogu se kategorizirati u životinjske izvore kao što je tenzin, biljne izvore kao što su peptidi soje, i mikrobne izvore kao što su peptidi Mycobacterium avium.
Ove klasifikacije se prepliću kako bi odražavale bogatu raznolikost peptida u strukturi, funkciji i primjeni.
Važni pojmovi vezani za peptide
Peptidna veza: Amidna veza -CO-NH- nastala dehidracijskom kondenzacijom α-karboksi grupe jedne amino kiseline sa α-amino grupom druge aminokiseline, koja je osnovna kovalentna veza koja povezuje aminokiselinske ostatke i čini peptide i proteine.
Oligopeptid: obično se odnosi na peptidna jedinjenja male molekularne težine, kao što su dipeptid, tripeptid, itd., koji se formiraju povezivanjem 2-20 aminokiselina putem peptidne veze, i imaju visoku biološku aktivnost i propusnost ćelijske membrane.
Polipeptid: peptid sastavljen od 20-50 aminokiselina, molekulska težina je obično manja od 10 kDa, može formirati jednostavnu prostornu strukturu kao što je α-heliks, funkcionalna je molekula između oligopeptida i proteina.
Primarna struktura: aminokiselinska sekvenca peptida, određena genetskim informacijama ili veštačkim dizajnom, je osnovna hemijska struktura peptida, koja direktno utiče na njegovu naprednu strukturu i biološku funkciju.
Sekundarna struktura: uređena konformacija formirana vodoničnim vezom u lokalnom području peptidnog lanca, kao što je α-helix, β-folding, β-turning, itd., koja nije stabilna kao kod proteina, ali je uključena u formiranje funkcionalnih mjesta.
Ciklični peptidi: peptidi koji formiraju cikličku strukturu povezujući prvu i posljednju aminokiselinu ili grupe bočnih lanaca, kao što su ciklosporin i kratki peptid, sa visokom stabilnošću i anti-enzimskim svojstvima, često sadrže prefiks 'ciklički' u nazivu.
Peptidi sintetizirani ribosomom: peptidi koje sintetiziraju ribozomi živih organizama putem translacije mRNA šablona, a njihove sekvence su kodirane genima, kao što su hormon inzulin i neurotransmiter endorfin.
Neribosomalni sintetički peptidi: peptidi sintetizirani posebnim kompleksima enzima kao što su peptidne sintetaze, koji se obično nalaze u mikroorganizmima kao što su bakterije i gljive, a mogu sadržavati neprirodne aminokiseline kao što su D-aminokiseline, npr. antibiotik Mycobacterium avium peptid.
Solid Phase Peptide Synthesis (SPPS): In vitro tehnologija sinteze umjetnih peptida, kroz sekvencijalno spajanje zaštićenih aminokiselina na nosaču smole, kroz deprotekciju, reakciju kondenzacije kako bi se postepeno produžio peptidni lanac, pogodan za kratku preciznost sinteze peptida.
