By Peptid Bilgisi 
1 Mayıs 2025
BU WEB SİTESİNDE VERİLEN TÜM MAKALELER VE ÜRÜN BİLGİLERİ YALNIZCA BİLGİ YAYINLAMA VE EĞİTİM AMAÇLIDIR.
Bu web sitesinde sunulan ürünler yalnızca in vitro araştırmalara yöneliktir. İn vitro araştırmalar (Latince: *camda*, cam eşyalarda anlamına gelir) insan vücudu dışında gerçekleştirilir. Bu ürünler farmasötik değildir, ABD Gıda ve İlaç İdaresi (FDA) tarafından onaylanmamıştır ve herhangi bir tıbbi durumu, hastalığı veya rahatsızlığı önlemek, tedavi etmek veya iyileştirmek için kullanılmamalıdır. Bu ürünlerin herhangi bir biçimde insan veya hayvan vücuduna sokulması kanunen kesinlikle yasaktır.
Peptit nedir?
'Peptit' terimi, Yunanca 'sindirmek' anlamına gelen 'πέσσειν' (péssein) kelimesinden gelir. Bir peptit, peptit bağları aracılığıyla bağlanan amino asitlerden oluşan bir bileşiktir. Amit bağları olan peptid bağları, bir amino asidin a-karboksil grubu ile diğerinin a-amino grubu arasındaki dehidrasyon yoğunlaşmasından kaynaklanır. Amino asit sayısına göre sınıflandırılan, 2 ila 20 amino asit içeren peptitler oligopeptitler, 20 ila 50 amino asit içerenler polipeptitler ve spesifik uzaysal yapılara sahip 50 amino asidi aşan diziler genellikle proteinler olarak sınıflandırılır. Peptitler tipik olarak 10 kDa'nın altında bir moleküler ağırlığa sahiptir. Birincil yapıları doğrusal bir amino asit dizisinden oluşur ve bazı peptitler, a-helisler gibi ikincil yapılar oluşturabilir. Çeşitli işlevler sergileyen peptitler, sinyal iletimi, metabolik düzenleme ve bağışıklık tepkileri dahil olmak üzere biyolojik süreçlerde yaygın olarak yer alır; bu da onları tıp, gıda bilimi ve diğer alanlardaki uygulamalarda hem yapısal çeşitliliğe hem de biyolojik işlevselliğe sahip önemli biyomoleküller haline getirir.
Peptitler Nasıl Oluşur?
| Peptit oluşumu, doğal olarak in vivo veya yapay olarak in vitro olarak meydana gelen, amino asitlerin peptit bağları yoluyla bağlanması yoluyla meydana gelir. Biyolojik sistemlerde ribozomal sentez, aktive edilmiş amino asitlerin belirli bir dizide düzenlenmesinde ribozomları yönlendirmek için genetik bilgi taşıyan mRNA'yı içerir. Transfer RNA'ları (tRNA'lar), amino asitleri ribozoma iletir; burada enzimatik kataliz, bir amino asidin a-karboksil grubu ile diğerinin a-amino grubu arasında dehidrasyon yoğunlaşmasını tahrik eder, bir amid (peptit) bağı oluşturur ve bir su molekülünü serbest bırakır; bu işlem oligopeptitler veya polipeptitler oluşturmak için tekrarlanır. Ribozomal olmayan sentez, antibiyotikler gibi biyoaktif peptitler üreten mikroorganizmalarda yaygın olarak gözlenen, peptit sentetazları gibi özel enzim komplekslerine dayanır. İn vitro sentezde öncelikle, korumalı amino asitlerin sırayla bir reçine desteğine bağlandığı katı fazlı peptid sentezi (SPPS) kullanılır; korumanın kaldırılması ve yoğunlaşma reaksiyonları peptit zincirini adım adım uzatır. Alternatif olarak hedef peptitler, doğal proteinlerin enzimatik hidrolizi yoluyla elde edilebilir. Peptit bağı oluşumu, peptitlerin ve proteinlerin birincil yapısında çekirdek bağlantı görevi gören kovalent bir bağlanma sürecini temsil eder. Peptit bağlarına ilişkin daha fazla ayrıntı 'Peptit Bağları' bölümünde tartışılmaktadır. |  |
Peptitlerin Adlandırılması
Peptitlerin isimlendirilmesi tipik olarak 'sayı + peptit' kuralına göre içerdikleri amino asitlerin sayısından türetilir. Örneğin bir dipeptit iki amino asitten, bir tripeptit üçten oluşur ve bu, on amino asitli bir dekapeptide kadar devam eder. Ondan fazla amino asit içeren peptitler doğrudan '11 - peptit', '20 - peptit' vb. olarak adlandırılır. Bu adlandırma sistemi genellikle a - peptit bağlarıyla bağlanan geleneksel doğrusal peptitler için geçerlidir. Ancak istisnalar mevcuttur:
Siklosporin ve gramisidin gibi bazı siklik peptitler, baş-kuyruk bağlantısı veya yan zincir siklizasyonu nedeniyle 'siklo -' önekiyle veya özel bir adla adlandırılır ve D-amino asitler gibi doğal olmayan bileşenler içerebilir.
γ-karboksil grubu ile a-amino grubu arasında oluşan bir 'γ-peptit bağına' sahip olan glutatyon gibi benzersiz bağlantıya sahip peptitler, doğrusal a-peptit bağ numaralandırma kurallarına uymaz.
Antimikrobiyal ve nöropeptitler gibi fonksiyonel peptitler, amino asit sayısından ziyade biyolojik fonksiyonlarına göre adlandırılır. Örneğin, 26 amino asitli bir antimikrobiyal peptit olan melitin.
Basitrasin ve aktinomisin gibi mikroorganizmalardan ribozomal olmayan şekilde sentezlenen peptitler, değiştirilmiş amino asitler içerir (örneğin, metillenmiş veya siklize edilmiş) ve amino asit sayısından ziyade benzersiz biyosentetik yollarından dolayı kaynaklarına veya işlevlerine göre adlandırılırlar.
Özet olarak bu istisnalar, yapısal özellikleri, sentetik yolları ve fonksiyonel özellikleri dikkate alması gereken peptid isimlendirmesinin çeşitli doğasını yansıtmaktadır.
Peptitlerin sınıflandırılması
Peptitler birden fazla boyutta kategorize edilebilir:
Amino asit sayısına göre dipeptit ve glutatyon gibi 2-20 arası peptitten oluşan oligopeptitler oldukça aktiftir; 20-50 peptid içeren polipeptitler, insülinojen fragmanları gibi basit uzaysal yapılar oluşturabilir; 50'den fazla peptid ve karmaşık fonksiyona sahip peptidler, genellikle 51 amino asit içeren insülin gibi proteinler olarak sınıflandırılır.
Kimyasal yapıya göre, doğrusal peptitler, enkefalin gibi a-peptit bağları ile bağlanır, siklik peptitler, siklosporin gibi ilk ve son kuyruk veya yan zincir boyunca bir halka oluşturur, modifiye edilmiş peptitler, aktinomisinin D-amino asitleri gibi doğal olmayan bileşenleri içerir ve glutatyon gibi özel olarak bağlanmış peptitler, y-peptit bağları ile bağlanır.
Sentez yöntemiyle, ribozomal sentetik peptitler, endorfinler gibi genler tarafından kodlanır, ribozomal olmayan sentetik peptitler, mikopeptitler gibi mikrobiyal enzim komplekslerine bağımlıdır ve sentetik peptitler, tıbbi oktreotid gibi kimyasal veya biyolojik yollarla hazırlanır.
İşlevsel olarak, sinyal peptitleri, tirotropin salgılayan hormon gibi iletimde rol oynar, antibakteriyel peptitler, arı zehiri peptitleri gibi bakteriyel membranları yok eder, nöropeptitler, analjezi için endorfinler gibi sinirleri düzenler ve ayrıca tıbbi peptitler ve fonksiyonel gıda peptitleri de vardır.
Kaynak olarak, süt kazein peptitleri gibi doğal peptitler organizmalarda veya gıdalarda bulunur ve sentetik peptitler, kozmetik oligopeptitler gibi yapay müdahale yoluyla doğal sınırlamaları aşar.
Biyolojik kaynaklara göre tensin gibi hayvan kaynakları, soya fasulyesi peptidleri gibi bitki kaynakları ve Mycobacterium avium peptidleri gibi mikrobiyal kaynaklar olarak kategorize edilebilirler.
Bu sınıflandırmalar, peptitlerin yapı, işlev ve uygulama açısından zengin çeşitliliğini yansıtacak şekilde iç içe geçmiştir.
Peptitlerle ilgili önemli terimler
Peptid bağı: Bir amino asidin α-karboksi grubunun başka bir amino asidin α-amino grubu ile dehidrasyon yoğunlaşması ile oluşan, amino asit kalıntılarını birbirine bağlayan ve peptitleri ve proteinleri oluşturan temel kovalent bağ olan amid bağı -CO-NH-.
Oligopeptid: Genellikle 2-20 amino asidin peptid bağı yoluyla bağlanmasıyla oluşan, yüksek biyolojik aktiviteye ve hücre zarı geçirgenliğine sahip olan dipeptid, tripeptit vb. gibi düşük molekül ağırlıklı peptid bileşiklerini ifade eder.
Polipeptit: 20-50 amino asitten oluşan, molekül ağırlığı genellikle 10 kDa'dan az olan, a-sarmal gibi basit uzaysal yapı oluşturabilen, oligopeptit ile protein arasında fonksiyonel bir molekül olan peptit.
Birincil yapı: Genetik bilgi veya yapay tasarımla belirlenen peptidin amino asit dizisi, peptidin gelişmiş yapısını ve biyolojik fonksiyonunu doğrudan etkileyen temel kimyasal yapısıdır.
İkincil yapı: Peptit zincirinin yerel bölgesinde hidrojen bağlanmasıyla oluşturulan, proteinlerinki kadar stabil olmayan ancak fonksiyonel bölgelerin oluşumunda rol oynayan, α-sarmal, β-katlama, β-dönme vb. gibi düzenli konformasyon.
Siklik peptitler: Siklosporin ve kısa peptit gibi ilk ve son amino asitleri veya yan zincir gruplarını bağlayarak siklik bir yapı oluşturan, yüksek stabiliteye ve anti-enzimatik özelliklere sahip, genellikle adında 'siklik' ön ekini içeren peptitler.
Ribozom tarafından sentezlenen peptitler: mRNA şablon çevirisi yoluyla canlı organizmaların ribozomları tarafından sentezlenen peptitler ve bunların dizileri, insülin hormonu ve nörotransmitter endorfin gibi genler tarafından kodlanır.
Ribozomal olmayan sentetik peptitler: bakteri ve mantarlar gibi mikroorganizmalarda yaygın olarak bulunan peptit sentetazları gibi özel enzim kompleksleri tarafından sentezlenen peptitler ve D-amino asitler gibi doğal olmayan amino asitler, örneğin antibiyotik Mycobacterium avium peptiti içerebilir.
Katı Faz Peptit Sentezi (SPPS): Kısa peptit sentezi hassasiyeti için uygun, peptit zincirini kademeli olarak uzatmak için korumanın kaldırılması, yoğunlaşma reaksiyonu yoluyla reçine taşıyıcı üzerinde korunan amino asitlerin sıralı bağlanması yoluyla in vitro yapay peptit sentez teknolojisi.
