Av peptidinformasjon 
1. mai 2025
ALLE ARTIKLER OG PRODUKTINFORMASJON GITT PÅ DETTE NETTSTEDET ER KUN FOR INFORMASJONSSPREDNING OG UTDANNINGSFORMÅL.
Produktene som tilbys på denne nettsiden er utelukkende ment for in vitro-forskning. In vitro-forskning (latin: *i glass*, som betyr i glass) utføres utenfor menneskekroppen. Disse produktene er ikke farmasøytiske produkter, er ikke godkjent av US Food and Drug Administration (FDA), og må ikke brukes til å forebygge, behandle eller kurere noen medisinsk tilstand, sykdom eller lidelse. Det er strengt forbudt ved lov å introdusere disse produktene i menneske- eller dyrekroppen i noen form.
Hva er et peptid?
Begrepet 'peptid' stammer fra det greske ordet 'πέσσειν' (péssein), som betyr 'å fordøye'. Et peptid er en forbindelse dannet av aminosyrer koblet sammen gjennom peptidbindinger. Peptidbindinger, som er amidbindinger, oppstår fra dehydreringskondensasjonen mellom α-karboksylgruppen til en aminosyre og α-aminogruppen til en annen. Klassifisert etter aminosyretall, kalles peptider med 2 til 20 aminosyrer oligopeptider, de med 20 til 50 er polypeptider, og sekvenser som overstiger 50 aminosyrer med spesifikke romlige strukturer er generelt kategorisert som proteiner. Peptider har typisk en molekylvekt under 10 kDa. Deres primære struktur består av en lineær aminosyresekvens, og noen peptider kan danne sekundære strukturer som α-helikser. Peptider har forskjellige funksjoner og er mye involvert i biologiske prosesser, inkludert signaltransduksjon, metabolsk regulering og immunresponser, noe som gjør dem til viktige biomolekyler med både strukturelt mangfold og biologisk funksjonalitet i applikasjoner på tvers av medisin, matvitenskap og andre felt.
Hvordan dannes peptider?
| Peptiddannelse skjer gjennom kobling av aminosyrer via peptidbindinger, som forekommer naturlig in vivo eller kunstig in vitro. I biologiske systemer involverer ribosomal syntese mRNA som bærer genetisk informasjon for å dirigere ribosomer i å arrangere aktiverte aminosyrer i en spesifikk sekvens. Overførings-RNA-er (tRNA-er) leverer aminosyrer til ribosomet, der enzymatisk katalyse driver dehydreringskondensasjon mellom α-karboksylgruppen til en aminosyre og α-aminogruppen til en annen, danner en amid-(peptid)binding og frigjør et vannmolekyl; denne prosessen gjentas for å generere oligopeptider eller polypeptider. Ikke-ribosomal syntese er avhengig av spesialiserte enzymkomplekser som peptidsyntetaser, ofte observert i mikroorganismer som produserer bioaktive peptider som antibiotika. In vitro syntese benytter primært fastfase peptidsyntese (SPPS), hvor beskyttede aminosyrer kobles sekvensielt til en harpiksbærer; avbeskyttelse og kondensasjonsreaksjoner utvider peptidkjeden trinnvis. Alternativt kan målpeptider oppnås via enzymatisk hydrolyse av naturlige proteiner. Peptidbindingsdannelse representerer en kovalent bindingsprosess, som fungerer som kjernekoblingen i den primære strukturen til peptider og proteiner. Ytterligere detaljer om peptidbindinger er diskutert i avsnittet 'Peptidbindinger.' |  |
Nomenklatur av peptider
Nomenklaturen av peptider stammer vanligvis fra antall aminosyrer de inneholder, etter konvensjonen av 'tall + peptid'. For eksempel består et dipeptid av to aminosyrer, et tripeptid tre, og dette fortsetter opp til et dekapeptid med ti aminosyrer. Peptider med mer enn ti aminosyrer er direkte navngitt som '11 - peptid', '20 - peptid', etc. Dette navnesystemet gjelder generelt for konvensjonelle lineære peptider forbundet med α - peptidbindinger. Det finnes imidlertid unntak:
Noen sykliske peptider, som cyklosporin og gramicidin, er navngitt med et 'cyklo -'-prefiks eller et proprietært navn på grunn av hode-til-hale-forbindelse eller sidekjede-syklisering, og kan inneholde ikke-naturlige komponenter som D-aminosyrer.
Peptider med unik tilkobling, slik som glutation, som har en 'γ-peptidbinding' dannet mellom γ-karboksylgruppen og α-aminogruppen, følger ikke den lineære α-peptidbindingsnummereringskonvensjonen.
Funksjonelle peptider, som antimikrobielle og nevropeptider, er navngitt basert på deres biologiske funksjoner i stedet for antall aminosyrer. For eksempel mellitin, et antimikrobielt peptid med 26 aminosyrer.
Ikke-ribosomalt syntetiserte peptider fra mikroorganismer, som bacitracin og actinomycin, inneholder modifiserte aminosyrer (f.eks. metylerte eller sykliserte) og er oppkalt etter deres kilde eller funksjon på grunn av deres unike biosyntetiske veier, snarere enn aminosyretall.
Oppsummert gjenspeiler disse unntakene den mangfoldige naturen til peptidnomenklaturen, som må ta hensyn til strukturelle egenskaper, syntetiske ruter og funksjonelle egenskaper.
Klassifisering av peptider
Peptider kan kategoriseres i flere dimensjoner:
Ved antall aminosyrer er oligopeptider bestående av 2-20 peptider som dipeptid og glutation svært aktive; polypeptider med 20-50 peptider kan danne enkle romlige strukturer som insulinogenfragmenter; peptider med mer enn 50 peptider og komplekse funksjoner kategoriseres vanligvis som proteiner, for eksempel insulin som inneholder 51 aminosyrer.
Ved kjemisk struktur er lineære peptider koblet med α-peptidbindinger som enkefalin, sykliske peptider danner en ring gjennom den første og siste halen eller sidekjeden som cyklosporin, modifiserte peptider inneholder unaturlige komponenter som D-aminosyrene til actinomycin, og spesielt koblede peptider som glutation-peptider er koblet med bindingspeptider.
Ved syntese er ribosomale syntetiske peptider kodet av gener som endorfiner, ikke-ribosomale syntetiske peptider er avhengige av mikrobielle enzymkomplekser som mykopeptider, og syntetiske peptider fremstilles på kjemiske eller biologiske måter som medisinsk oktreotid.
Ved funksjon er signalpeptider involvert i overføring som tyrotropinfrigjørende hormon, antibakterielle peptider ødelegger bakteriemembraner som bigiftpeptider, nevropeptider regulerer nerver som endorfiner for smertestillende midler, og det finnes også medisinske peptider og funksjonelle matpeptider.
Etter kilde eksisterer naturlige peptider i organismer eller mat, for eksempel meierikaseinpeptider, og syntetiske peptider bryter gjennom naturlige begrensninger gjennom kunstig intervensjon, for eksempel kosmetiske oligopeptider.
Etter biologiske kilder kan de kategoriseres i animalske kilder som tensin, plantekilder som soya-peptider og mikrobielle kilder som Mycobacterium avium-peptider.
Disse klassifiseringene flettes sammen for å gjenspeile det rike mangfoldet av peptider i struktur, funksjon og anvendelse.
Viktige termer knyttet til peptider
Peptidbinding: Amidbindingen -CO-NH- dannet ved dehydreringskondensering av α-karboksygruppen til en aminosyre med α-aminogruppen til en annen aminosyre, som er den grunnleggende kovalente bindingen som forbinder aminosyrerester og utgjør peptider og proteiner.
Oligopeptid: refererer vanligvis til lavmolekylære peptidforbindelser, som dipeptid, tripeptid, etc., som dannes ved å koble 2-20 aminosyrer gjennom peptidbinding, og har høy biologisk aktivitet og cellemembranpermeabilitet.
Polypeptid: peptid sammensatt av 20-50 aminosyrer, molekylvekt er vanligvis mindre enn 10 kDa, kan danne enkel romlig struktur som α-helix, er et funksjonelt molekyl mellom oligopeptid og protein.
Primærstruktur: aminosyresekvensen til peptid, bestemt av genetisk informasjon eller kunstig design, er den grunnleggende kjemiske strukturen til peptid, som direkte påvirker dets avanserte struktur og biologiske funksjon.
Sekundær struktur: den ordnede konformasjonen dannet av hydrogenbinding i det lokale området av peptidkjeden, slik som α-helix, β-folding, β-vending, etc., som ikke er like stabil som proteiner, men er involvert i dannelsen av funksjonelle steder.
Sykliske peptider: peptider som danner en syklisk struktur ved å forbinde den første og siste aminosyren eller sidekjedegruppene, som cyklosporin og kort peptid, med høy stabilitet og anti-enzymatiske egenskaper, ofte inneholdende prefikset 'syklisk' i navnet.
Ribosomsyntetiserte peptider: peptider syntetisert av ribosomene til levende organismer gjennom mRNA-maloversettelse, og sekvensene deres er kodet av gener, som hormonet insulin og nevrotransmitteren endorfin.
Ikke-ribosomale syntetiske peptider: peptider syntetisert av spesielle enzymkomplekser som peptidsyntetaser, vanligvis funnet i mikroorganismer som bakterier og sopp, og kan inneholde unaturlige aminosyrer som D-aminosyrer, f.eks. antibiotikumet Mycobacterium avium peptid.
Solid Phase Peptide Synthesis (SPPS): In vitro kunstig peptidsynteseteknologi, gjennom sekvensiell kobling av beskyttede aminosyrer på harpiksbæreren, gjennom avbeskyttelsen, kondensasjonsreaksjonen for å gradvis forlenge peptidkjeden, egnet for kort peptidsyntesepresisjon.
